139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3941 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  100 
 
 		 168 aa  330  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  87.5 
 
 		 171 aa  273  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  45.12 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  44.31 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  44.31 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  42.33 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.13 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  34.38 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.9 
 
 		 195 aa  91.3  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  33.54 
 
 		 161 aa  90.9  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.9 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  33.74 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.26 
 
 		 161 aa  84.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.67 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.78 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.93 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.28 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.28 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.28 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.28 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.97 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.56 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.95 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.76 
 
 		 215 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  37.14 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.72 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  33.13 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  36.92 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.53 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.26 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.13 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.85 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.25 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  31.33 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  36.17 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  33.33 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.23 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.98 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.1 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.3 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.39 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  34.23 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.17 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  34.23 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  33.04 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  33.04 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  33.04 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  33.04 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  32 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.61 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.74 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  33.33 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.79 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  31.25 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.3 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.44 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  34.38 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.3 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.8 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.89 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  28.81 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  37.37 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  37.37 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  37.37 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.02 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.55 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.9 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.42 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  30.47 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  38.41 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.41 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.54 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  25.15 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1141  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.92 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.5 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.56 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.67 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2675  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.54 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546891  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.65 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  31.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.93 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.36 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.91 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.46 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  33.75 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  33.64 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  34.82 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  36.08 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  36.08 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  36.08 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  36.08 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  36.08 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  35.56 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>