More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3931 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 437 aa  872    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  86.27 
 
 		 437 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  58.68 
 
 		 440 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  54.34 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  54.57 
 
 		 436 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  52.64 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  52.64 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  52.63 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  46.77 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  49.09 
 
 		 438 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  47.52 
 
 		 445 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  44.91 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  46.61 
 
 		 462 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  47.37 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  45.52 
 
 		 451 aa  333  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  46.92 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  45.88 
 
 		 449 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  45.33 
 
 		 448 aa  322  8e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  44.64 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  45.52 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  45.01 
 
 		 457 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  44.98 
 
 		 435 aa  312  7.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  44.57 
 
 		 428 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  44.44 
 
 		 447 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  44.16 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  42.95 
 
 		 429 aa  303  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  45.68 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  44.72 
 
 		 437 aa  295  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  45.55 
 
 		 455 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  44.7 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  42.14 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  44.98 
 
 		 444 aa  293  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  43.49 
 
 		 455 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  42.23 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  41.28 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  41.28 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  41.28 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  41.28 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  41.28 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  41.98 
 
 		 454 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 453 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  39.3 
 
 		 453 aa  288  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  40.39 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 		 453 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  41.13 
 
 		 454 aa  285  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  41.13 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 479 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  39.12 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  45.56 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  40.91 
 
 		 454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  41.28 
 
 		 455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  39.25 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 460 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  40.18 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  40.18 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 454 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  44.92 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4256  tRNA modification GTPase TrmE  38.9 
 
 		 453 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  40.75 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  41.76 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  42.82 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  38.46 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  40.44 
 
 		 454 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  43.18 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  38.82 
 
 		 455 aa  276  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 454 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  40.7 
 
 		 456 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  42.44 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  39.56 
 
 		 458 aa  276  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  41.69 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  38.14 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  38.89 
 
 		 489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  41.19 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  39.11 
 
 		 452 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  37.94 
 
 		 453 aa  274  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  39.24 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  39.13 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  38.77 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 454 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  40.05 
 
 		 428 aa  269  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  40.58 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  37.72 
 
 		 453 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 		 456 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.67 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>