More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3917 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  90.87 
 
 
460 aa  812    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
462 aa  917    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  69.76 
 
 
470 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  64.72 
 
 
493 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  54.01 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  53.8 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.88 
 
 
453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  54.32 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  51.79 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  49.78 
 
 
450 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  46.99 
 
 
456 aa  398  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  50.67 
 
 
450 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  49.77 
 
 
450 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  48.97 
 
 
450 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  49.09 
 
 
450 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  49.55 
 
 
450 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  48.09 
 
 
471 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  44.93 
 
 
463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  45.06 
 
 
448 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.65 
 
 
447 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.35 
 
 
425 aa  310  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.31 
 
 
459 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  49.09 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  47.5 
 
 
440 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  49.35 
 
 
438 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  47.64 
 
 
448 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.65 
 
 
426 aa  269  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.86 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  42.86 
 
 
419 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  40.29 
 
 
443 aa  242  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  40.42 
 
 
438 aa  240  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.46 
 
 
422 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  39.86 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  43.73 
 
 
438 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  40.5 
 
 
437 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  32.1 
 
 
440 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.22 
 
 
415 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.62 
 
 
535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.08 
 
 
410 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.03 
 
 
422 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  38.28 
 
 
424 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.55 
 
 
427 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  32.59 
 
 
426 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  32.68 
 
 
426 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  32.14 
 
 
427 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  33.41 
 
 
427 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  31.49 
 
 
452 aa  202  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  33.18 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  31.92 
 
 
425 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  32.13 
 
 
427 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  32.09 
 
 
436 aa  196  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  34.69 
 
 
428 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  34.69 
 
 
428 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  34.44 
 
 
428 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  32.88 
 
 
428 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  34.44 
 
 
429 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  33.16 
 
 
429 aa  192  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  34.06 
 
 
428 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  33.16 
 
 
429 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  33.67 
 
 
429 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  33.67 
 
 
428 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  31.28 
 
 
462 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  32.97 
 
 
427 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  31.07 
 
 
429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.07 
 
 
462 aa  183  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  33.42 
 
 
429 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  32.44 
 
 
434 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  30.63 
 
 
429 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  30 
 
 
445 aa  180  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  32.27 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  32.27 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  32.27 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  32.27 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  32.27 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  32.52 
 
 
429 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  32.52 
 
 
429 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  32.66 
 
 
431 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  32.2 
 
 
429 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.03 
 
 
436 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  32.44 
 
 
429 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  32.2 
 
 
429 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.87 
 
 
452 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  32.03 
 
 
429 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  31.66 
 
 
435 aa  177  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  31.44 
 
 
429 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  32.11 
 
 
429 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  31.44 
 
 
429 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  31.95 
 
 
429 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  32.03 
 
 
429 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  34.6 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  30.72 
 
 
443 aa  173  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  31.95 
 
 
437 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  33.89 
 
 
451 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  36.55 
 
 
431 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  36.29 
 
 
429 aa  170  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.23 
 
 
443 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  28.19 
 
 
430 aa  170  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  27.94 
 
 
430 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  34.23 
 
 
432 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>