100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3868 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  43.03 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.74 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  37.59 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  30.6 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  35.97 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  35.86 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 366 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  31.43 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1743  hypothetical protein  29.38 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000786691  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  34.69 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  28.49 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  28.49 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  35.9 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  29.71 
 
 		 435 aa  54.7  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  29.71 
 
 		 435 aa  54.7  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 396 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  38.71 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  36.99 
 
 		 359 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  33.09 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  36.84 
 
 		 350 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  31.62 
 
 		 362 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  31.48 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  38.46 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  32 
 
 		 296 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  28.83 
 
 		 352 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  30.32 
 
 		 349 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  37.89 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  28.29 
 
 		 367 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  25.28 
 
 		 400 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  35.19 
 
 		 307 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  37.37 
 
 		 383 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  30 
 
 		 355 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  31.78 
 
 		 269 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  41.38 
 
 		 401 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  31.58 
 
 		 354 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  27.68 
 
 		 370 aa  48.5  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  30.26 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  32.74 
 
 		 227 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  26.13 
 
 		 425 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  32.41 
 
 		 277 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  35.16 
 
 		 292 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  28.69 
 
 		 286 aa  47.4  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.8 
 
 		 367 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  26.51 
 
 		 367 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  36.08 
 
 		 372 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  29.82 
 
 		 349 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  26.81 
 
 		 386 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  38.24 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  35.56 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  32.08 
 
 		 302 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  37.36 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  34.44 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01690  predicted Zn peptidase  27.93 
 
 		 246 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  38.24 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  38.24 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  31.15 
 
 		 272 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  33.07 
 
 		 370 aa  44.7  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  32.63 
 
 		 295 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  32.63 
 
 		 295 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  32.63 
 
 		 295 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  33.64 
 
 		 295 aa  44.3  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  26.81 
 
 		 356 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  30.25 
 
 		 291 aa  44.3  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  31.72 
 
 		 1177 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  25.88 
 
 		 251 aa  44.3  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  26.56 
 
 		 376 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1463  protein of unknown function DUF955  25.79 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  30.7 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  37.66 
 
 		 246 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  29.55 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  32.38 
 
 		 360 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  27.59 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  32.63 
 
 		 1180 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  30.07 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  35.82 
 
 		 302 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  23.64 
 
 		 355 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  32.73 
 
 		 355 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  34.12 
 
 		 144 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  34.12 
 
 		 144 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  37.33 
 
 		 342 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  31.46 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  35.71 
 
 		 395 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  30.94 
 
 		 283 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  31.46 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  31.46 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  25.32 
 
 		 347 aa  41.2  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  40 
 
 		 357 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  28.32 
 
 		 129 aa  41.2  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  36.9 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  44.26 
 
 		 416 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  32.53 
 
 		 285 aa  40.8  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  40.98 
 
 		 295 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>