28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3793 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3793  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00053208  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4122  hypothetical protein  91.22 
 
 
324 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1474  hypothetical protein  69.47 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.545512  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6020  hypothetical protein  68.54 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1716  hypothetical protein  47.42 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2528  hypothetical protein  46.58 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120567  normal  0.11407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0187  hypothetical protein  49.34 
 
 
323 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0529  hypothetical protein  47.1 
 
 
362 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2886  hypothetical protein  46.6 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2508  hypothetical protein  46.6 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0653  hypothetical protein  46.6 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2199  hypothetical protein  46.6 
 
 
366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0040  hypothetical protein  46.6 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0639  hypothetical protein  46.28 
 
 
362 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0816  hypothetical protein  46.47 
 
 
690 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5842  hypothetical protein  43.55 
 
 
350 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4394  hypothetical protein  43.55 
 
 
351 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3634  hypothetical protein  42.3 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4108  hypothetical protein  42.48 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0619238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1807  hypothetical protein  42.35 
 
 
352 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0168  hypothetical protein  41.25 
 
 
322 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4211  hypothetical protein  41.75 
 
 
351 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.973045  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4155  hypothetical protein  41.75 
 
 
351 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3306  hypothetical protein  41.75 
 
 
351 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5364  hypothetical protein  43.08 
 
 
344 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5839  hypothetical protein  36.81 
 
 
327 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1075  hypothetical protein  39.59 
 
 
323 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.752555  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5356  hypothetical protein  34.56 
 
 
327 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>