33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3780 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  94.37 
 
 
444 aa  877    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  916    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  57.08 
 
 
437 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  51.54 
 
 
427 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  50.93 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  49.88 
 
 
443 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  46.56 
 
 
439 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  45.95 
 
 
474 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  42.6 
 
 
525 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  41.15 
 
 
560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  42.11 
 
 
534 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  40.71 
 
 
561 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  40.91 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  39.44 
 
 
505 aa  292  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  36.05 
 
 
929 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  35.29 
 
 
450 aa  250  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  34.34 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.93 
 
 
1967 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  34.8 
 
 
466 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  31.49 
 
 
396 aa  195  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  29.56 
 
 
555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  28.8 
 
 
556 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  28.34 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  29.39 
 
 
733 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  30.65 
 
 
432 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  28.03 
 
 
457 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  29.66 
 
 
420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  29.98 
 
 
424 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  26.47 
 
 
460 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  25.33 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  25.34 
 
 
457 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  29.98 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  26.22 
 
 
429 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>