More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3732 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  97.02 
 
 
235 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  82.67 
 
 
239 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  80 
 
 
211 aa  335  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  75.12 
 
 
242 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  74.31 
 
 
242 aa  322  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  75.12 
 
 
242 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  67.11 
 
 
235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  68.66 
 
 
246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  68.2 
 
 
251 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  67.89 
 
 
240 aa  304  9.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  68.66 
 
 
246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  67.28 
 
 
247 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  66.67 
 
 
230 aa  298  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  65.77 
 
 
228 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  62.28 
 
 
260 aa  284  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  62.28 
 
 
230 aa  284  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  62.95 
 
 
241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  63.51 
 
 
231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  62.11 
 
 
227 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  63.4 
 
 
235 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  64.52 
 
 
231 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  63.72 
 
 
237 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  60.81 
 
 
230 aa  262  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  57.59 
 
 
237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  69.59 
 
 
174 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  56.5 
 
 
230 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  57.71 
 
 
228 aa  245  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  58.48 
 
 
229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  58.59 
 
 
202 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  56.67 
 
 
233 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  57.59 
 
 
229 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 
229 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  52.23 
 
 
234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  51.12 
 
 
252 aa  231  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  52.56 
 
 
217 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  55.35 
 
 
258 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  50 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  51.35 
 
 
224 aa  224  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  56.22 
 
 
234 aa  224  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
227 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  55.5 
 
 
234 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
227 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  55.05 
 
 
228 aa  221  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  51.75 
 
 
228 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  51.75 
 
 
228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  58.08 
 
 
226 aa  218  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  53.88 
 
 
242 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  53.88 
 
 
242 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  53.88 
 
 
242 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  53.88 
 
 
246 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  50.23 
 
 
228 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  50.87 
 
 
249 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  54.25 
 
 
249 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  52.04 
 
 
227 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  53.88 
 
 
251 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  51.49 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  54.25 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  52.04 
 
 
227 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  53.96 
 
 
253 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  51.4 
 
 
219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  48.64 
 
 
236 aa  211  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
224 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  51.52 
 
 
246 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
233 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  47.96 
 
 
228 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  52.53 
 
 
247 aa  207  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  46.64 
 
 
228 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
230 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  53.81 
 
 
200 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  51.74 
 
 
238 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 
219 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
224 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  52.02 
 
 
249 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  47.53 
 
 
250 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  47.53 
 
 
242 aa  205  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  49.54 
 
 
227 aa  205  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  53.06 
 
 
249 aa  204  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.53 
 
 
228 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.53 
 
 
228 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.53 
 
 
228 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  48.78 
 
 
232 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.53 
 
 
228 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  50.24 
 
 
249 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  47.53 
 
 
228 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  47.53 
 
 
228 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.53 
 
 
228 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  46.9 
 
 
228 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  47.53 
 
 
228 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.53 
 
 
228 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.53 
 
 
228 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.53 
 
 
228 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.53 
 
 
228 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  47.6 
 
 
241 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  50.75 
 
 
237 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.98 
 
 
228 aa  202  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  47.3 
 
 
237 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  47.71 
 
 
224 aa  202  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  51.69 
 
 
239 aa  201  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 
237 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.364354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>