138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3723 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  100 
 
 
317 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  96.85 
 
 
317 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  88.01 
 
 
317 aa  561  1e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  76.66 
 
 
317 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  77.7 
 
 
321 aa  459  1e-128  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  77.36 
 
 
321 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  65.62 
 
 
316 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  58.11 
 
 
322 aa  358  6e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  55.92 
 
 
321 aa  355  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  59.48 
 
 
319 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  57.19 
 
 
321 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  57.82 
 
 
324 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  53.53 
 
 
324 aa  337  2e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  57.38 
 
 
323 aa  336  3e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.03 
 
 
327 aa  335  5e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  54.78 
 
 
325 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  54.46 
 
 
325 aa  328  5e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  53.06 
 
 
322 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  52.72 
 
 
322 aa  315  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  52.08 
 
 
322 aa  314  1e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  54.15 
 
 
323 aa  313  2e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  52.68 
 
 
323 aa  314  2e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  51.76 
 
 
323 aa  312  6e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  51.7 
 
 
344 aa  307  2e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  52.04 
 
 
341 aa  305  4e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  52.04 
 
 
341 aa  305  7e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  51.7 
 
 
326 aa  302  5e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  52.04 
 
 
326 aa  301  7e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.72 
 
 
323 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  52.72 
 
 
323 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  52.38 
 
 
321 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  50.51 
 
 
343 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.38 
 
 
323 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.38 
 
 
323 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.38 
 
 
323 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  52.38 
 
 
323 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.38 
 
 
323 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  51.36 
 
 
329 aa  298  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  52.04 
 
 
321 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  51.7 
 
 
321 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  51.7 
 
 
321 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  51.7 
 
 
321 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  52.04 
 
 
323 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  46.67 
 
 
329 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  45.02 
 
 
341 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  45.89 
 
 
325 aa  278  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  43.83 
 
 
320 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  44.26 
 
 
324 aa  276  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  50.17 
 
 
370 aa  272  5e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  48.47 
 
 
349 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  48.48 
 
 
349 aa  262  6e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  45.21 
 
 
337 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  41.12 
 
 
329 aa  246  5e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  40.82 
 
 
337 aa  244  1e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  43.49 
 
 
335 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  40.28 
 
 
322 aa  238  9e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  40 
 
 
332 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  39.38 
 
 
332 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  43.84 
 
 
330 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  42.95 
 
 
336 aa  225  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  40.19 
 
 
320 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  38.23 
 
 
338 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.36 
 
 
584 aa  215  7e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  40.74 
 
 
340 aa  214  1e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  38.3 
 
 
319 aa  213  3e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  43.88 
 
 
270 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  36.68 
 
 
333 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  35.52 
 
 
334 aa  201  1e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  40.21 
 
 
328 aa  201  2e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  36.68 
 
 
313 aa  200  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  33.56 
 
 
328 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  38.41 
 
 
331 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  36.42 
 
 
331 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  35.11 
 
 
331 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.75 
 
 
320 aa  185  8e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  31.71 
 
 
329 aa  182  5e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  34.13 
 
 
327 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  31.72 
 
 
347 aa  174  1e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  35.64 
 
 
329 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.95 
 
 
334 aa  167  3e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.22 
 
 
359 aa  163  4e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  31.65 
 
 
298 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  30.66 
 
 
640 aa  141  1e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.25 
 
 
344 aa  139  9e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  28.77 
 
 
344 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  30.77 
 
 
322 aa  132  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.1 
 
 
352 aa  132  1e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  129  8e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  27.24 
 
 
324 aa  129  8e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  27.62 
 
 
320 aa  128  1e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  30.1 
 
 
355 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  29.14 
 
 
328 aa  117  2e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  29.31 
 
 
322 aa  116  4e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  29.33 
 
 
384 aa  115  1e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  28.62 
 
 
354 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  30.21 
 
 
329 aa  108  9e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  26.28 
 
 
324 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  27.34 
 
 
320 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  29.2 
 
 
328 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  28.16 
 
 
329 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>