208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3706 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  72.45 
 
 		 114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  82.98 
 
 		 96 aa  137  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  76.6 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  75.26 
 
 		 194 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  76.6 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  58.06 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  55.43 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  51.55 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  53.76 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  70.21 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  53.68 
 
 		 97 aa  103  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  54.64 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  60.67 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  61.63 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  61.63 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  55.91 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  55.91 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  58.67 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  55.56 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  62.67 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  58.57 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  57.35 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  58.82 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  44.57 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  40.96 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  56.25 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  43.04 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  48.72 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  53.23 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  51.9 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  40.45 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  41.24 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  43.37 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  62.26 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  38.04 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  33.68 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  38.37 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  37.62 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  36.63 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  37 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  36.46 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  33.68 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  37.23 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  35.05 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  34.41 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  35.56 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  35.64 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  37.11 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  37.11 
 
 		 213 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  37.11 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  37.11 
 
 		 213 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  37.11 
 
 		 213 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  37.11 
 
 		 213 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  37.11 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  37.35 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  35.23 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  36.67 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  37.78 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  36.27 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  41.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  41.67 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  36.67 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  34.78 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  41.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  41.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  36.67 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  36.67 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  41.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  41.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  41.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  34.78 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  34.07 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  30.68 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  35.16 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  31.4 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  40 
 
 		 196 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  30.68 
 
 		 182 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  31.82 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>