More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3664 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  93.88 
 
 		 247 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  48.76 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  48.54 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  36.56 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  35.04 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  36.48 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  36.24 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  36.05 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  36.05 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  35.19 
 
 		 489 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  34.89 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  34.2 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  35.5 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  32.92 
 
 		 529 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  37.44 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  32.92 
 
 		 509 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  32.92 
 
 		 509 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  37 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  32.64 
 
 		 505 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  33.62 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  34.3 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  34.33 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  33.62 
 
 		 237 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  34.65 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  31.47 
 
 		 545 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  31.65 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  35.54 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  32.76 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  33.62 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  32.76 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  31.78 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.57 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  32.91 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  30.83 
 
 		 532 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  32.2 
 
 		 241 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  30.67 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  30.45 
 
 		 241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  32.16 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  30.84 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  32.64 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  31.62 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  33.47 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.57 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  34.76 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  32.63 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  32.68 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  32.56 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  34.59 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  31.92 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  31.11 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.91 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  31.31 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  32.18 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  31.98 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  34.33 
 
 		 508 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.02 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  35.35 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  28.44 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  37.21 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  31.78 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  32.09 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  30.04 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  34.67 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  30.94 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  31.89 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.82 
 
 		 212 aa  98.6  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  31.63 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  31.63 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  31.63 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.84 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  32.86 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  32.39 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.09 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  29.83 
 
 		 231 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  30.66 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.86 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.67 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.62 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  32.74 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.62 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.63 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  29.44 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.11 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.91 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6068  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  27.53 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  30.88 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.16 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.57 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.64 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.89 
 
 		 198 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.6 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.78 
 
 		 428 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.66 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  28.64 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  30.62 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 187 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>