More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3631 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  100 
 
 		 158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  98.1 
 
 		 158 aa  320  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  87.9 
 
 		 159 aa  286  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  81.13 
 
 		 159 aa  273  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  62 
 
 		 157 aa  196  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  62.24 
 
 		 157 aa  190  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  51.7 
 
 		 154 aa  174  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  53.47 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  53.47 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  50.98 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  50.71 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  50.69 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  49.29 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  50 
 
 		 155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  45.07 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  44.6 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  44.6 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  42.57 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  45.38 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  42.14 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  44.44 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  42.96 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  38.57 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  40.6 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  33.55 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  31.58 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  32.62 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  33.33 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  32.17 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  32.17 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  32.17 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  36.67 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  31.47 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  30.92 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.06 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.21 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 		 183 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  36.49 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.46 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.46 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  32.67 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  32.43 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  32.43 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  32.43 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  33.58 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  32.84 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  32.17 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  33.99 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  34.84 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  34.97 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  34.97 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  30.92 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  30.92 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  30.92 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  30.92 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  30.92 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  30.92 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  30.92 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  30.92 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  30.41 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  34.03 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  32.61 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  30.67 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.68 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  31.08 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  32.09 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.68 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  32.09 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  31.88 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  31.88 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  31.88 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  31.88 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  31.88 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  31.88 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  30.87 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  30.77 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  34.62 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  35.71 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  30.94 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  30.97 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  34.33 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  30.26 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  30.67 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  30.97 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  31.88 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  32.84 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  28.48 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 175 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 175 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 175 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 175 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 175 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 175 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>