295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3601 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  100 
 
 
74 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  95.89 
 
 
74 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  66.18 
 
 
78 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  61.43 
 
 
76 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  59.42 
 
 
90 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  58.33 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  59.42 
 
 
78 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  50 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  47.06 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  45.59 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  46.38 
 
 
80 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  47.89 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  50.7 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  50 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  46.48 
 
 
93 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  47.89 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  41.79 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  47.95 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  43.84 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40.3 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  49.28 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  40.3 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  48.53 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  47.06 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  41.18 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  43.84 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  46.38 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  45.71 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  40.3 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  39.19 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  40.54 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  41.79 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  37.14 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  42.65 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  40.3 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  38.36 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  41.1 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  36.76 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  41.79 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  41.79 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  55.77 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  50 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  46.88 
 
 
76 aa  60.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  37.31 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  41.18 
 
 
213 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  36.76 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  47.46 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  35.71 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  43.1 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  47.27 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  38.24 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  38.81 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  37.31 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  38.81 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  45.31 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  40.3 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  39.71 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  41.18 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  47.27 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  47.27 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  38.81 
 
 
77 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  39.06 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  36.62 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  37.31 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  37.31 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  34.29 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  32.86 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  37.31 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  37.31 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  37.31 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  46.3 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  41.54 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  37.31 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  37.31 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  41.38 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  41.38 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  41.38 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  41.38 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  41.38 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  41.38 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  41.38 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  41.38 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  37.31 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  37.31 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  37.31 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  37.31 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  34.33 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  39.71 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>