More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3532 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  94.19 
 
 
258 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  60 
 
 
236 aa  300  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  63.01 
 
 
258 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  52.23 
 
 
262 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  55.36 
 
 
262 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  55.36 
 
 
262 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
258 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  53.02 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  51.52 
 
 
255 aa  218  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  50.22 
 
 
255 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  50.22 
 
 
255 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  49.57 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  46.48 
 
 
271 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  45.38 
 
 
255 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  45.41 
 
 
253 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  47.01 
 
 
268 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
272 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  45.69 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  42.62 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 
254 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
269 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  49.19 
 
 
264 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
279 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  38.49 
 
 
255 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
246 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  38.53 
 
 
248 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  39.26 
 
 
242 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.24 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
215 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  35.74 
 
 
269 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  38.91 
 
 
238 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  39.66 
 
 
245 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
239 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.44 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34.75 
 
 
243 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.92 
 
 
240 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  33.48 
 
 
240 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  37.68 
 
 
217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.87 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  35.09 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.2 
 
 
229 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  40.51 
 
 
231 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  33.92 
 
 
240 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  34.07 
 
 
237 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
239 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  33.48 
 
 
233 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 
239 aa  121  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.93 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  34.36 
 
 
243 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  35.44 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  36.32 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  33.05 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  32.75 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.36 
 
 
215 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.32 
 
 
228 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 
230 aa  109  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  36.68 
 
 
239 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  33.02 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  31.82 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.69 
 
 
234 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.17 
 
 
233 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  35.04 
 
 
255 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.69 
 
 
234 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
279 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  35.71 
 
 
245 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
231 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
247 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.55 
 
 
263 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  30.13 
 
 
237 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  26.27 
 
 
270 aa  105  9e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  30.43 
 
 
233 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  31.96 
 
 
247 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  29.57 
 
 
233 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  33.2 
 
 
256 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.82 
 
 
261 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
236 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  33.05 
 
 
233 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  31.91 
 
 
249 aa  102  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  33.61 
 
 
268 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 
223 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
239 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  34.07 
 
 
233 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
246 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
261 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.31 
 
 
246 aa  99  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  31.33 
 
 
227 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  30.86 
 
 
244 aa  99  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  31.33 
 
 
227 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.72 
 
 
251 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.96 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  33.04 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  32.91 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>