More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3482 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 405 aa  830    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  93.32 
 
 		 405 aa  777    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  56.46 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  54.5 
 
 		 424 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  46.94 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  35.45 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  32.75 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 348 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  32.75 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  31.44 
 
 		 447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.67 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  33.92 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  34.26 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  30.05 
 
 		 450 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  33.97 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  34.03 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  32.63 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 421 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.49 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  31.39 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 		 406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 		 367 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  30.63 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 		 517 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  29.4 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.39 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  40.74 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  38.6 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  37.77 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  28.64 
 
 		 701 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  28.17 
 
 		 701 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  29.82 
 
 		 859 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  28.9 
 
 		 860 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.69 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.18 
 
 		 614 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.48 
 
 		 861 aa  99.4  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.89 
 
 		 632 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  32.46 
 
 		 632 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 		 858 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 		 564 aa  96.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.34 
 
 		 696 aa  96.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  29.55 
 
 		 636 aa  96.3  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 469 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  35.95 
 
 		 591 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  31.53 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  29.77 
 
 		 488 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 		 911 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.57 
 
 		 672 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  35.19 
 
 		 528 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 		 699 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  35.19 
 
 		 528 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  35.19 
 
 		 528 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.65 
 
 		 585 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 		 558 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.9 
 
 		 652 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 		 746 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.21 
 
 		 656 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 		 903 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 864 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  30.52 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.88 
 
 		 678 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.79 
 
 		 638 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  30.69 
 
 		 483 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 		 364 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.69 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  34.3 
 
 		 536 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  31.55 
 
 		 1134 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  30 
 
 		 645 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  35.19 
 
 		 532 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  32.86 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.54 
 
 		 500 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.31 
 
 		 645 aa  87.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  33.72 
 
 		 549 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 		 740 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  31.75 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 		 712 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 		 735 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 		 741 aa  87  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  32.24 
 
 		 571 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  31.75 
 
 		 759 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 		 437 aa  86.7  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 		 1119 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  27.11 
 
 		 675 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  29.68 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  32.92 
 
 		 577 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 		 702 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.62 
 
 		 658 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>