More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3419 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  96.48 
 
 
488 aa  966    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  84.68 
 
 
485 aa  867    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
484 aa  997    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  80.54 
 
 
484 aa  827    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
493 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 
505 aa  509  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
509 aa  511  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
493 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
493 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
509 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
494 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
493 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
493 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
514 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
494 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
493 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
493 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
503 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
493 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
493 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  48 
 
 
494 aa  474  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
506 aa  438  1e-121  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
489 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
504 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
504 aa  400  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
476 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
500 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
492 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
506 aa  369  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
480 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
490 aa  367  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
479 aa  361  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
487 aa  358  9e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
486 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
492 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
494 aa  351  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
484 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
491 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
489 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
495 aa  346  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
482 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
493 aa  340  4e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
477 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.88 
 
 
495 aa  335  7.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
490 aa  332  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
488 aa  332  8e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
480 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
490 aa  329  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
485 aa  329  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
504 aa  329  9e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
488 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
502 aa  326  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
502 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
502 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
494 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
501 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
503 aa  323  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
485 aa  323  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
485 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
464 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
502 aa  318  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
496 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
464 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
506 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
507 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
500 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
491 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
501 aa  313  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
516 aa  312  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
479 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
510 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
512 aa  311  2e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
498 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
495 aa  307  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
504 aa  306  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
492 aa  306  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
491 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
490 aa  305  8.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
463 aa  302  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
480 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
469 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
511 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
464 aa  300  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
491 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>