220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3318 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  100 
 
 
350 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  92.86 
 
 
350 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  66.67 
 
 
348 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  62.03 
 
 
348 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  60.46 
 
 
349 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  59.36 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  59.6 
 
 
349 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  49.86 
 
 
345 aa  309  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  47.83 
 
 
350 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3029  threonine aldolase  48.7 
 
 
357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  46.53 
 
 
353 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.93 
 
 
356 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  44.25 
 
 
349 aa  295  7e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  48.7 
 
 
353 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1169  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.97 
 
 
353 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  45.71 
 
 
365 aa  292  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  44.35 
 
 
349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  45.87 
 
 
347 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  43.93 
 
 
341 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  43.52 
 
 
351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  41.01 
 
 
355 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  44.13 
 
 
343 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  43.77 
 
 
346 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  43.93 
 
 
341 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  44.09 
 
 
348 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  43.77 
 
 
350 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  44.09 
 
 
348 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  43.81 
 
 
343 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  44.13 
 
 
343 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  45.01 
 
 
341 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  39.07 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  41.45 
 
 
353 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  45.05 
 
 
346 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  44.73 
 
 
346 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  42.29 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  44.87 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  45.63 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  39.83 
 
 
350 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  37.82 
 
 
355 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  40.81 
 
 
364 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  39.83 
 
 
349 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  38.26 
 
 
351 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  37.36 
 
 
346 aa  228  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  42.49 
 
 
345 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  41.03 
 
 
353 aa  225  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.71 
 
 
352 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  42.99 
 
 
348 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  40.71 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  40.38 
 
 
346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  40.38 
 
 
346 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  40.06 
 
 
346 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  40.38 
 
 
346 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  36.49 
 
 
347 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  37.9 
 
 
352 aa  215  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  40.38 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  40.38 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  39.71 
 
 
340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  39.6 
 
 
365 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  40.06 
 
 
341 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  38.78 
 
 
346 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  41.09 
 
 
339 aa  208  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  39.53 
 
 
346 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  37.57 
 
 
362 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  38.04 
 
 
361 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  38.04 
 
 
371 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  40.71 
 
 
348 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  37.46 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  38.9 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  40.06 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  40.06 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  35.88 
 
 
357 aa  193  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  39.14 
 
 
369 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  37.46 
 
 
343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  34.01 
 
 
359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  38.08 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  36.86 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  35.57 
 
 
352 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  40.76 
 
 
362 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  36.47 
 
 
375 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.31 
 
 
375 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  37.5 
 
 
358 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  37.5 
 
 
358 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  37.22 
 
 
358 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  38.37 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  35.33 
 
 
387 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  38.29 
 
 
374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  37.21 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  33.63 
 
 
350 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  33.13 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  30.48 
 
 
342 aa  152  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  32.85 
 
 
357 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  29.71 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  34.82 
 
 
339 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  33.14 
 
 
340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  29.46 
 
 
339 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  26.65 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2927  Threonine aldolase  31.18 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0857  threonine aldolase  27.51 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1377  hypothetical protein  26.42 
 
 
351 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1404  hypothetical protein  26.42 
 
 
351 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.265494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>