32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3308 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  91.67 
 
 
513 aa  915    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  100 
 
 
511 aa  1024    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  48.2 
 
 
467 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  47.76 
 
 
505 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  35.15 
 
 
528 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  38.08 
 
 
515 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  33.51 
 
 
502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  33.24 
 
 
512 aa  212  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  31.51 
 
 
647 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  31.51 
 
 
646 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  30.49 
 
 
597 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  28.22 
 
 
528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  26.03 
 
 
546 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  26.61 
 
 
590 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  26.27 
 
 
592 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  25.69 
 
 
617 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  25.95 
 
 
564 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  28.36 
 
 
571 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  27.22 
 
 
566 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  26.94 
 
 
423 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  26.06 
 
 
563 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  25.83 
 
 
540 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  25.71 
 
 
568 aa  93.6  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  24.01 
 
 
563 aa  93.6  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  22.1 
 
 
552 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  24.52 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  27.11 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  25.82 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  21.3 
 
 
420 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  24.36 
 
 
537 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  27.04 
 
 
437 aa  51.6  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0790  hypothetical protein  21.51 
 
 
441 aa  43.5  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.843096  normal  0.984184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>