More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3250 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  663  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  94.55 
 
 
330 aa  574  1e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  81.21 
 
 
330 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  72.91 
 
 
321 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  56.01 
 
 
339 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  54.73 
 
 
328 aa  335  8e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  51.01 
 
 
330 aa  325  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  51.03 
 
 
330 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  49.39 
 
 
331 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  52.12 
 
 
335 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  52.19 
 
 
335 aa  314  1e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  48.77 
 
 
327 aa  313  2e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  50.15 
 
 
328 aa  313  3e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  51.8 
 
 
360 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  50.84 
 
 
337 aa  307  2e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  50.16 
 
 
327 aa  306  4e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  50.65 
 
 
345 aa  305  9e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  48.16 
 
 
335 aa  305  9e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  50.83 
 
 
328 aa  305  1e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  45.86 
 
 
322 aa  305  1e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  47.24 
 
 
335 aa  304  1e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  50.65 
 
 
345 aa  304  1e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  50.5 
 
 
328 aa  303  2e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  49.03 
 
 
328 aa  302  5e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  47.44 
 
 
333 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  47.23 
 
 
331 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  50.5 
 
 
328 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  52.68 
 
 
334 aa  298  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  49.38 
 
 
327 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49.5 
 
 
324 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.19 
 
 
333 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.47 
 
 
349 aa  295  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.68 
 
 
339 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.32 
 
 
325 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.32 
 
 
327 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.18 
 
 
330 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  48.24 
 
 
698 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.18 
 
 
330 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.42 
 
 
321 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.41 
 
 
336 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.82 
 
 
328 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  48.87 
 
 
339 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  51.2 
 
 
339 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.57 
 
 
325 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.96 
 
 
325 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  48.69 
 
 
341 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  47.84 
 
 
353 aa  289  5e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.7 
 
 
344 aa  289  5e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.54 
 
 
325 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  48.79 
 
 
327 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  48.83 
 
 
331 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.51 
 
 
333 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.75 
 
 
335 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  46.69 
 
 
331 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.81 
 
 
328 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.95 
 
 
330 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  47.84 
 
 
328 aa  286  3e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  49.17 
 
 
322 aa  286  3e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  46.62 
 
 
337 aa  286  3e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  46.8 
 
 
318 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  50.51 
 
 
325 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  46.35 
 
 
320 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  51.01 
 
 
323 aa  284  1e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  45.19 
 
 
323 aa  285  1e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  48.67 
 
 
326 aa  285  1e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  48.15 
 
 
324 aa  284  2e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.36 
 
 
304 aa  283  3e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  46.25 
 
 
322 aa  283  3e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  4.67968e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  47.7 
 
 
337 aa  283  4e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.85 
 
 
330 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  48 
 
 
335 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  47.7 
 
 
332 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  47.54 
 
 
336 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  45.68 
 
 
343 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  47.9 
 
 
330 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  46.95 
 
 
325 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  49.84 
 
 
330 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  45.05 
 
 
356 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  47.71 
 
 
326 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.15 
 
 
330 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.42 
 
 
334 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  44.87 
 
 
320 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.0806e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46 
 
 
322 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  46.64 
 
 
324 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  44.98 
 
 
339 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  46.38 
 
 
310 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.45 
 
 
358 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  45.03 
 
 
336 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  44.55 
 
 
359 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  44.86 
 
 
341 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.43 
 
 
325 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.15 
 
 
333 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  44 
 
 
330 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  47.83 
 
 
324 aa  274  1e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  44.48 
 
 
337 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  47.81 
 
 
335 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.95 
 
 
324 aa  273  4e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  45.83 
 
 
341 aa  273  4e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  44.2 
 
 
328 aa  273  4e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>