More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3141 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3141  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 249 aa  500  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0400922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3413  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  86.35 
 
 		 249 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3131  cyclic nucleotide-binding protein  68.95 
 
 		 245 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3403  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.07 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.878713  normal  0.236856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0375  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.887845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.23 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.85 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.24 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  29.9 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1482  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.04 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.053801  hitchhiker  0.0000318932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  21.76 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  21.76 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  21.76 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  21.76 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  21.76 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  21.76 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0519  Fnr-like transcriptional activator  25.81 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.88 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.8 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.27 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  21.76 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  22.05 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1015  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000202163  unclonable  0.0000000139192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  21.76 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  21.76 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1379  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  21.24 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.88 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  22.75 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  26.42 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  21.24 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.48 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.21 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  21.24 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  21.24 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  21.24 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  21.24 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  24.75 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.5 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  22.87 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  22.16 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.28 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  26.52 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.89 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  21.35 
 
 		 355 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  21.62 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  22.34 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2084  cyclic nucleotide-binding  25.13 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  24.21 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.8 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4138  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.8 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  26.94 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  21.62 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4026  cyclic nucleotide-binding protein  22.8 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  24.47 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  23.12 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  24 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  21.62 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  21.08 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  21.08 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.79 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.51 
 
 		 354 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  22.28 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  21.08 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>