More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3065 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  48.22 
 
 
1166 aa  913    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  54.15 
 
 
1124 aa  1124    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  53.69 
 
 
1122 aa  1186    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  49.6 
 
 
1161 aa  1072    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  48.92 
 
 
1131 aa  1019    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  57.68 
 
 
1113 aa  1229    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  54.45 
 
 
1124 aa  1182    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.78 
 
 
1178 aa  973    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  76.49 
 
 
1125 aa  1773    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.93 
 
 
1175 aa  1021    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.63 
 
 
1122 aa  1208    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.73 
 
 
1202 aa  999    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.78 
 
 
1195 aa  966    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.93 
 
 
1121 aa  1024    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  49.42 
 
 
1132 aa  1095    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.31 
 
 
1146 aa  1014    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.07 
 
 
1127 aa  1026    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.82 
 
 
1197 aa  1029    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.5 
 
 
1173 aa  940    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  53.59 
 
 
1122 aa  1185    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  46.31 
 
 
1100 aa  953    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  53.53 
 
 
1130 aa  1164    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  53.74 
 
 
1071 aa  1066    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.66 
 
 
1140 aa  940    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  54.24 
 
 
1120 aa  1118    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.07 
 
 
1197 aa  999    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  94.95 
 
 
1128 aa  2202    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.66 
 
 
1140 aa  940    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  49.5 
 
 
1140 aa  955    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  46.13 
 
 
1211 aa  972    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1128 aa  2295    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  49.45 
 
 
1153 aa  1026    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  44.45 
 
 
1220 aa  946    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  53.95 
 
 
1071 aa  1068    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  46.67 
 
 
1140 aa  941    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  76.74 
 
 
1126 aa  1773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.28 
 
 
1154 aa  1061    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  47.53 
 
 
1121 aa  1057    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  45.56 
 
 
1170 aa  961    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.79 
 
 
1127 aa  1114    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 
1085 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
555 aa  509  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  48.98 
 
 
573 aa  502  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
874 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0610  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein  41.52 
 
 
568 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0985  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.8 
 
 
575 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1280  hypothetical protein  40.75 
 
 
596 aa  361  5e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.961931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3405  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.43 
 
 
570 aa  347  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.286515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  37.16 
 
 
781 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
939 aa  289  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13491  integral membrane protein  39.44 
 
 
443 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.134076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  39.33 
 
 
1323 aa  284  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1664  histidine kinase  39.06 
 
 
530 aa  283  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.586003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
784 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1323 aa  283  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  35.55 
 
 
2051 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
721 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
811 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
922 aa  271  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
865 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
989 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1611 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  36.54 
 
 
810 aa  260  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
937 aa  259  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1578 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
1285 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
720 aa  251  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
770 aa  251  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1068 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
1322 aa  251  7e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
1090 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
1090 aa  250  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
989 aa  250  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
929 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  36.5 
 
 
800 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 
1058 aa  241  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
844 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
844 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
750 aa  234  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
633 aa  234  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1099 aa  234  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
935 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
1002 aa  228  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  34.37 
 
 
1257 aa  226  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
1002 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
1002 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
1199 aa  219  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1022 aa  219  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
747 aa  218  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
970 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
945 aa  216  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1452 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
975 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
841 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
803 aa  214  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
974 aa  214  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.78 
 
 
763 aa  214  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
977 aa  213  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
823 aa  213  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1410 aa  212  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>