More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3021 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  92.78 
 
 
264 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  62.45 
 
 
262 aa  324  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  58.62 
 
 
267 aa  315  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  55.08 
 
 
260 aa  288  7e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  54.23 
 
 
260 aa  285  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  52.69 
 
 
270 aa  275  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  54.72 
 
 
257 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  52.49 
 
 
263 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  44.06 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  43.18 
 
 
262 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  42.15 
 
 
258 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  39.15 
 
 
266 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.76 
 
 
256 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  41.98 
 
 
274 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  44.92 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  45.31 
 
 
262 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  37.07 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  39.3 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  41.15 
 
 
277 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 
266 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 
266 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 
266 aa  175  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  40.24 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  36.68 
 
 
270 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  39.3 
 
 
269 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  37.65 
 
 
288 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  40.49 
 
 
261 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  37.25 
 
 
288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  37.25 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  34.5 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  37.6 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  35.41 
 
 
272 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  36.47 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  38.1 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  38.76 
 
 
255 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  35.61 
 
 
264 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  36.15 
 
 
269 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  37.6 
 
 
264 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  35.02 
 
 
272 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  39.15 
 
 
255 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  37.08 
 
 
254 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  36.19 
 
 
269 aa  159  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  33.98 
 
 
260 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  36.78 
 
 
258 aa  158  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  34.51 
 
 
259 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  37.26 
 
 
292 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  37.15 
 
 
265 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  39.85 
 
 
271 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  36.29 
 
 
255 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  37.17 
 
 
282 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  38.64 
 
 
255 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  36.19 
 
 
259 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  34.63 
 
 
260 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  39.04 
 
 
271 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  37.4 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 
259 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  34.83 
 
 
269 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  40.08 
 
 
259 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  34.47 
 
 
272 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  36.02 
 
 
424 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  33.85 
 
 
274 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  35.66 
 
 
255 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  38.53 
 
 
265 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  36.4 
 
 
260 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
490 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  38.43 
 
 
260 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  35.25 
 
 
419 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  40.23 
 
 
262 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.12 
 
 
409 aa  149  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  34.36 
 
 
258 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  37.69 
 
 
264 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  38.19 
 
 
271 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  34.85 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  32.71 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  36.33 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  33.47 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  38.96 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  36.78 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.78 
 
 
258 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  36.68 
 
 
271 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  36.25 
 
 
252 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  36.33 
 
 
427 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  35.27 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 
255 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  35.61 
 
 
260 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  37.35 
 
 
271 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  35.52 
 
 
418 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.87 
 
 
253 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.66 
 
 
268 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  38.08 
 
 
270 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  35.91 
 
 
253 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.31 
 
 
269 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  36.43 
 
 
258 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  34.36 
 
 
424 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.08 
 
 
266 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.69 
 
 
266 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  34.98 
 
 
253 aa  142  6e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>