More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3001 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.99 
 
 		 578 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 		 578 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  57.17 
 
 		 578 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  92.82 
 
 		 581 aa  1057    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  60.58 
 
 		 594 aa  684    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  57.17 
 
 		 578 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  57.17 
 
 		 578 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  79.01 
 
 		 582 aa  894    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 		 578 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  59.51 
 
 		 580 aa  681    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  59.55 
 
 		 580 aa  680    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  56.99 
 
 		 578 aa  665    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  57.17 
 
 		 578 aa  666    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  56.74 
 
 		 578 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  57.86 
 
 		 580 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  57.53 
 
 		 585 aa  667    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  56.74 
 
 		 578 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  58.65 
 
 		 582 aa  680    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  56.74 
 
 		 578 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  75.66 
 
 		 580 aa  838    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  100 
 
 		 585 aa  1171    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  58.76 
 
 		 583 aa  675    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  61.89 
 
 		 578 aa  685    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  56.1 
 
 		 579 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  58.46 
 
 		 576 aa  683    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  62.01 
 
 		 590 aa  694    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  61.57 
 
 		 575 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  58.29 
 
 		 580 aa  669    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  57.37 
 
 		 578 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  79.27 
 
 		 576 aa  874    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  61.8 
 
 		 590 aa  691    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  56.99 
 
 		 578 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  56.99 
 
 		 578 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  57.86 
 
 		 580 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  54.51 
 
 		 599 aa  597  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  57.34 
 
 		 578 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  55.09 
 
 		 579 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  50.91 
 
 		 617 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  50.94 
 
 		 592 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 		 592 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  51.74 
 
 		 593 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  50.88 
 
 		 593 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  49.91 
 
 		 588 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  47.83 
 
 		 587 aa  527  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  48.63 
 
 		 599 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 		 551 aa  521  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 589 aa  514  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 583 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  50 
 
 		 1106 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 		 541 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  45.62 
 
 		 512 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43.64 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.46 
 
 		 651 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  41.99 
 
 		 920 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  41.73 
 
 		 904 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  42.65 
 
 		 917 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  40.1 
 
 		 918 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.18 
 
 		 667 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  40.49 
 
 		 909 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  40.59 
 
 		 912 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  41.2 
 
 		 912 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  39.27 
 
 		 915 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  39.62 
 
 		 912 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  40.45 
 
 		 925 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  41.16 
 
 		 994 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  41.48 
 
 		 912 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.55 
 
 		 907 aa  363  6e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  39.09 
 
 		 918 aa  363  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  39 
 
 		 932 aa  363  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  40.81 
 
 		 916 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  38.54 
 
 		 928 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  38.51 
 
 		 930 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  39.97 
 
 		 927 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  39.69 
 
 		 921 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  41 
 
 		 916 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.44 
 
 		 914 aa  356  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  37.83 
 
 		 921 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  38.77 
 
 		 922 aa  343  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  38.05 
 
 		 906 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  38.39 
 
 		 906 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  36.54 
 
 		 929 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  37.04 
 
 		 901 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  36.87 
 
 		 901 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  35.53 
 
 		 901 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 1171 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  34.73 
 
 		 916 aa  279  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  54.81 
 
 		 320 aa  273  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  55.56 
 
 		 324 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  55.6 
 
 		 333 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  32.99 
 
 		 935 aa  267  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  35.17 
 
 		 943 aa  266  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  59.73 
 
 		 314 aa  266  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  54.09 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  35.01 
 
 		 912 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  35.01 
 
 		 924 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 312 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  53.54 
 
 		 319 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 319 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  35.05 
 
 		 911 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  56.34 
 
 		 322 aa  249  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>