More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2834 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  95.25 
 
 		 526 aa  1038    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 526 aa  1080    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 549 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  50.2 
 
 		 545 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  45.64 
 
 		 533 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  42.61 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  44.47 
 
 		 532 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  43.22 
 
 		 525 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  42.96 
 
 		 532 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  43.22 
 
 		 525 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  42.78 
 
 		 525 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  43.85 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  43.23 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  43.69 
 
 		 529 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  43.29 
 
 		 529 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  41.62 
 
 		 528 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  41.17 
 
 		 543 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  41.17 
 
 		 558 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  41.17 
 
 		 558 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  41.17 
 
 		 558 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  41.17 
 
 		 543 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  42.6 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  41.17 
 
 		 543 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  41.17 
 
 		 543 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 		 526 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  41.17 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  41.73 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  40.75 
 
 		 543 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  41.93 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  42.74 
 
 		 543 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  42.74 
 
 		 543 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  41.05 
 
 		 528 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  42.74 
 
 		 543 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  42.74 
 
 		 543 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  42.74 
 
 		 543 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  41.37 
 
 		 536 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  39.88 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 544 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  39.92 
 
 		 532 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 		 561 aa  372  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  40.44 
 
 		 545 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 		 535 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  40.49 
 
 		 533 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  39.96 
 
 		 554 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 545 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  38.55 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  38.55 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  38.55 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  38.55 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  38.55 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  38.55 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  38.55 
 
 		 537 aa  363  6e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.63 
 
 		 545 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  38.55 
 
 		 537 aa  362  8e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  39.58 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  37.98 
 
 		 528 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  39.67 
 
 		 558 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  38.55 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  40.62 
 
 		 543 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  37.52 
 
 		 538 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  38.7 
 
 		 538 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  38.7 
 
 		 538 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 538 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  38.17 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  37.98 
 
 		 537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  38.17 
 
 		 537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  37.98 
 
 		 537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  39.07 
 
 		 539 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  38.17 
 
 		 537 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  37.94 
 
 		 560 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  37.2 
 
 		 556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  39.28 
 
 		 547 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  38.19 
 
 		 537 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  38.49 
 
 		 538 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  38.07 
 
 		 539 aa  352  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  36.64 
 
 		 556 aa  350  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  37.34 
 
 		 547 aa  350  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 		 538 aa  349  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 544 aa  349  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 		 545 aa  349  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  38.08 
 
 		 555 aa  349  9e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  41.04 
 
 		 537 aa  346  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  37.71 
 
 		 543 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 542 aa  343  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  36.93 
 
 		 538 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  37.84 
 
 		 545 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 558 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  39 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  39 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  38.8 
 
 		 535 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  39 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  39 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  39 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  37.93 
 
 		 541 aa  336  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  38.6 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  35.95 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 549 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  36.24 
 
 		 536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0757  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  35.51 
 
 		 538 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>