More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2646 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  77.8 
 
 		 419 aa  681    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  97.14 
 
 		 419 aa  804    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  78.43 
 
 		 422 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 419 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  78.28 
 
 		 419 aa  685    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  79.71 
 
 		 419 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  79.24 
 
 		 419 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  72.14 
 
 		 419 aa  612  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  68.26 
 
 		 417 aa  610  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  65.39 
 
 		 418 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  61.93 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  61.28 
 
 		 429 aa  514  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  60.96 
 
 		 422 aa  491  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  52.45 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 427 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.25 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 408 aa  90.1  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.53 
 
 		 458 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  28.76 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.72 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.46 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.87 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.78 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.29 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.8 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.3 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.68 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.39 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.12 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.23 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  25.41 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.47 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.91 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>