More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2623 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  89.94 
 
 		 318 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  64.83 
 
 		 317 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  56 
 
 		 342 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  40.2 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  42.47 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  41.78 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  40 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  37.5 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.6 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  38.69 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.62 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  37.16 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  38.91 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  34.59 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  35.88 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  33.11 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  34.15 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.8 
 
 		 292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  30.89 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  31.42 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  33.92 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  29.17 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  32.7 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.73 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  29.83 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  29.11 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  32.46 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.52 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.67 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.58 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  30.38 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  26.35 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  32.61 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  29.15 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  30.66 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  31.65 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  29.82 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  33.6 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  30.17 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.26 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  28.67 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  28.09 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  29.74 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  27.59 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  30.9 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  26.09 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  30.9 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  31.46 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  33.01 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  34.15 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  25.75 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  31.32 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.65 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  29.2 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  29.2 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  28.33 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.73 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  25.75 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  30.93 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  26.95 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  25.96 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  29.44 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  33.59 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  29.72 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  26.92 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  30.05 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.57 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  26.48 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  30.64 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  27.34 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  29.37 
 
 		 294 aa  89.4  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  26.34 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  28.18 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  26 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  23.92 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  26.21 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2496  hypothetical protein  32 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.580148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  25.74 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 339 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  30.08 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 298 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  29.06 
 
 		 290 aa  86.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  29.79 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  26.9 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  26.57 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>