More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2610 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
211 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  96.68 
 
 
211 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  64.93 
 
 
210 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  59.72 
 
 
208 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  59.9 
 
 
206 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.82 
 
 
204 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  51.66 
 
 
208 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 
205 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  47.5 
 
 
209 aa  174  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.29 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  53.81 
 
 
215 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  50.45 
 
 
240 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53 
 
 
208 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  53.85 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  51.87 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  53.25 
 
 
207 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  53.25 
 
 
207 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  53.25 
 
 
207 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  53.25 
 
 
207 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  53.25 
 
 
207 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.24 
 
 
215 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.83 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  43.6 
 
 
211 aa  151  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  49.07 
 
 
211 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  52.66 
 
 
207 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  40.95 
 
 
208 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 
209 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.6 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  37.26 
 
 
212 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.79 
 
 
159 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 
213 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.07 
 
 
211 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  33.8 
 
 
213 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  38 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.23 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.32 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
203 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.23 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.6 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.94 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  39.39 
 
 
203 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 
207 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.41 
 
 
206 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.58 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.5 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.26 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.69 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.41 
 
 
206 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.11 
 
 
210 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 
206 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  34.74 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.15 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.5 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 
206 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  35.89 
 
 
209 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 
206 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.45 
 
 
206 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  34.93 
 
 
206 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  34.93 
 
 
206 aa  111  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 
206 aa  111  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  34.93 
 
 
206 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.1 
 
 
206 aa  111  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 
206 aa  111  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 
206 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  33.94 
 
 
218 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
205 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 
206 aa  111  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.01 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  34.27 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  33.18 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.01 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  33.18 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.01 
 
 
206 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  33.5 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
209 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 
205 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.01 
 
 
206 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.65 
 
 
206 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 
205 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2082  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 
205 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2910  hypothetical protein  36.32 
 
 
211 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>