More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2556 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  39.48 
 
 
1031 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 
1031 aa  700    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.46 
 
 
1024 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  39.48 
 
 
1031 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.96 
 
 
1029 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  62.87 
 
 
1043 aa  1253    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.96 
 
 
1031 aa  714    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  36.09 
 
 
1037 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 
1042 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  38.78 
 
 
1030 aa  703    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  38.95 
 
 
1035 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  97.15 
 
 
1051 aa  2038    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1051 aa  2092    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  59.51 
 
 
1048 aa  1140    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  59.41 
 
 
1048 aa  1138    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  39.3 
 
 
1034 aa  694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  38.45 
 
 
1028 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  62.67 
 
 
1043 aa  1248    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  43.48 
 
 
1037 aa  782    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  58.89 
 
 
1049 aa  1167    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  41.39 
 
 
1052 aa  699    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  39.46 
 
 
1038 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  38.84 
 
 
1031 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  39 
 
 
1031 aa  701    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  38.91 
 
 
1035 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  40.77 
 
 
1046 aa  687    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  68.53 
 
 
1044 aa  1414    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  38.74 
 
 
1036 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  63.7 
 
 
1040 aa  1308    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  39.67 
 
 
1031 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  39.67 
 
 
1031 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  42.55 
 
 
1036 aa  759    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  35.67 
 
 
1034 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  40.97 
 
 
1040 aa  690    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  63 
 
 
1050 aa  1231    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  39.67 
 
 
1031 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.51 
 
 
1034 aa  675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  39.48 
 
 
1031 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  42.03 
 
 
1048 aa  773    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  39.04 
 
 
1031 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  53.74 
 
 
1044 aa  1120    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  41.62 
 
 
1038 aa  705    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  45.58 
 
 
1038 aa  855    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  35.93 
 
 
1037 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  35.92 
 
 
1037 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  37.95 
 
 
1041 aa  626  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  39.42 
 
 
1045 aa  622  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  38.23 
 
 
1041 aa  622  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  36.89 
 
 
1022 aa  622  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  34.87 
 
 
1068 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  37.41 
 
 
1048 aa  620  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 
1032 aa  617  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  35.67 
 
 
1036 aa  617  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  35.8 
 
 
1036 aa  619  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  38.04 
 
 
1024 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  34.58 
 
 
1030 aa  611  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 
1064 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 
1029 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  36.32 
 
 
1033 aa  609  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  36.83 
 
 
1023 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  35.73 
 
 
1051 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  36.05 
 
 
1035 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  36.56 
 
 
1042 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  35.84 
 
 
1035 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  35.22 
 
 
1037 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 
1051 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 
1037 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 
1051 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 
1051 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 
1047 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  35.28 
 
 
1047 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 
1047 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  33.56 
 
 
1026 aa  597  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.92 
 
 
1046 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  35.28 
 
 
1047 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  38.23 
 
 
1025 aa  595  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  34.58 
 
 
1046 aa  595  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 
1036 aa  581  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  37.5 
 
 
1040 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  34.52 
 
 
1029 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0857  acriflavin resistance protein  36.34 
 
 
1033 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533856  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  36.25 
 
 
1018 aa  549  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  36.25 
 
 
1018 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  35.51 
 
 
1009 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  34.94 
 
 
1028 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 
1034 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  35.62 
 
 
1014 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  35.42 
 
 
1014 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001981  RND multidrug efflux transporter  34.57 
 
 
1040 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 
1034 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  32.13 
 
 
1019 aa  523  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 
1037 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 
1040 aa  526  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0528  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 
1026 aa  526  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  35.2 
 
 
1014 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  32.03 
 
 
1019 aa  522  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  34.31 
 
 
1040 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  32.59 
 
 
1015 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  34.65 
 
 
1024 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  35.08 
 
 
1014 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>