More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2509 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
402 aa  779    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  93.53 
 
 
402 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  69.08 
 
 
406 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  62.89 
 
 
401 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  59.24 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  53.79 
 
 
393 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  57.7 
 
 
407 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  63.2 
 
 
413 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  56.59 
 
 
396 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  52.31 
 
 
389 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  52.31 
 
 
389 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  60.45 
 
 
408 aa  362  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  47.47 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  47.94 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  49.59 
 
 
398 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  50.77 
 
 
447 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  47.44 
 
 
395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  48.57 
 
 
405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  48.31 
 
 
405 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  48.31 
 
 
405 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  48.68 
 
 
398 aa  315  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  47.51 
 
 
404 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  48.16 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  45.66 
 
 
404 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  51.68 
 
 
401 aa  292  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  46.34 
 
 
400 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  46.34 
 
 
400 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  46.34 
 
 
400 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  46.29 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  45.96 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  48.53 
 
 
400 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  37.82 
 
 
406 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  37.82 
 
 
406 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  37.89 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  37.82 
 
 
403 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  48.09 
 
 
399 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  43.5 
 
 
416 aa  255  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  45.69 
 
 
399 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  52.28 
 
 
409 aa  250  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  46.82 
 
 
433 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  46.72 
 
 
422 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  45.1 
 
 
399 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  37.92 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  45.36 
 
 
399 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  44.69 
 
 
415 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  47.4 
 
 
431 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  38.79 
 
 
395 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.44 
 
 
399 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.18 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  47.75 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.32 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.71 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.17 
 
 
399 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.9 
 
 
405 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  41.62 
 
 
404 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37.98 
 
 
403 aa  226  7e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  45.55 
 
 
427 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
399 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.75 
 
 
399 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  47.38 
 
 
427 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.75 
 
 
399 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.75 
 
 
399 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 
419 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  47.12 
 
 
427 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  47.12 
 
 
427 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 
415 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  42.64 
 
 
399 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  41.64 
 
 
383 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  45.16 
 
 
442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  45.16 
 
 
433 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000291886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  44.91 
 
 
422 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000623855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  38.74 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  41.55 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  40 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.4 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
413 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 
399 aa  209  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.89 
 
 
399 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  39.89 
 
 
405 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
406 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  39.89 
 
 
399 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  39.89 
 
 
399 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.89 
 
 
399 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.89 
 
 
399 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.89 
 
 
399 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
394 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  37.02 
 
 
401 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 
389 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
419 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 
403 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  47.4 
 
 
423 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  0.000000000803869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 
410 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  39 
 
 
403 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  39.32 
 
 
401 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  39.78 
 
 
391 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.27 
 
 
394 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.27 
 
 
394 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.27 
 
 
394 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>