112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2390 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  100 
 
 
271 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  89.67 
 
 
271 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  70.85 
 
 
272 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  70.48 
 
 
273 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  70.7 
 
 
276 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  69.12 
 
 
272 aa  374  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  69.23 
 
 
276 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  68.5 
 
 
276 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  66.42 
 
 
276 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  66.3 
 
 
276 aa  362  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  65.58 
 
 
276 aa  359  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  65.82 
 
 
277 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  63.14 
 
 
276 aa  343  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  62.77 
 
 
276 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  59.63 
 
 
281 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  59.63 
 
 
281 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  58.39 
 
 
275 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  43.21 
 
 
297 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  56.55 
 
 
152 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  51.95 
 
 
182 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  59.26 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  59.26 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  59.26 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  59.26 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  59.26 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  53.42 
 
 
152 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  59.26 
 
 
142 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  59.26 
 
 
142 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  56.03 
 
 
143 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  51.66 
 
 
157 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  51.66 
 
 
157 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  50.99 
 
 
157 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  52.94 
 
 
140 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  47.62 
 
 
288 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  47.68 
 
 
285 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  48.25 
 
 
155 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  47.33 
 
 
156 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  46.48 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.85 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  52.38 
 
 
128 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  44.85 
 
 
144 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  35.71 
 
 
363 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  34.93 
 
 
146 aa  94.7  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  31.79 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  40 
 
 
333 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  36.11 
 
 
306 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  37.66 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  37.18 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  34.59 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  37.18 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  37.18 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  37.18 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  37.18 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  37.01 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  38.41 
 
 
141 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  36.81 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  38.69 
 
 
143 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  32.91 
 
 
312 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  36.05 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  32.35 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  34.69 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  36.64 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  36.62 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  32.39 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  31.97 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  33.53 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  36.64 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  35.33 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  33.13 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  36.36 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  37.12 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  34.09 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  35.21 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  35.81 
 
 
320 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  35.81 
 
 
320 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  33.82 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  53.85 
 
 
93 aa  62.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
106 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  35.79 
 
 
113 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  34.09 
 
 
125 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  40.74 
 
 
308 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 
185 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  33.33 
 
 
302 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  35.9 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 
141 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 
103 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 
325 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 
325 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
101 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  33.66 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  31.19 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
106 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  32.29 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  30.56 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>