276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2370 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  54.48 
 
 		 1198 aa  1268    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1272 aa  2585    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  80.78 
 
 		 1237 aa  2055    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1129 aa  94.7  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  30 
 
 		 586 aa  77.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  31.82 
 
 		 378 aa  70.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.77 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 361 aa  64.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 649 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.94 
 
 		 1022 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.32 
 
 		 706 aa  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.44 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.65 
 
 		 620 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 878 aa  61.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 		 267 aa  60.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.15 
 
 		 1056 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 3145 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.24 
 
 		 462 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 265 aa  60.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.57 
 
 		 810 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 792 aa  59.7  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  24.51 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 847 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 643 aa  58.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 626 aa  57.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 597 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 808 aa  57  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 927 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 471 aa  57.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.63 
 
 		 916 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 265 aa  56.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 311 aa  56.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 968 aa  56.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.93 
 
 		 668 aa  56.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 632 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 208 aa  56.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 614 aa  55.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 626 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 290 aa  56.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 614 aa  55.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 615 aa  56.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 614 aa  55.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 450 aa  55.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 292 aa  55.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.1 
 
 		 367 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 873 aa  55.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 542 aa  55.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  29.14 
 
 		 444 aa  55.5  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 594 aa  55.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 280 aa  55.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 557 aa  55.1  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 614 aa  55.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 614 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3255  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 354 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360912 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.1 
 
 		 626 aa  54.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.34 
 
 		 778 aa  54.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  30.94 
 
 		 502 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 502 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  29.66 
 
 		 539 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 323 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 766 aa  53.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 392 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 4079 aa  53.5  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 547 aa  53.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.65 
 
 		 629 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  27.52 
 
 		 864 aa  53.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  27.5 
 
 		 369 aa  53.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 502 aa  53.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 		 612 aa  53.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 923 aa  53.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 		 988 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 265 aa  53.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 331 aa  53.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 620 aa  53.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.17 
 
 		 818 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 286 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1503  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.13 
 
 		 862 aa  53.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 217 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.6 
 
 		 286 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.37 
 
 		 739 aa  52.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1406 aa  53.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  30.9 
 
 		 612 aa  52.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2050  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024552  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  24.55 
 
 		 442 aa  52  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.69 
 
 		 406 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  28.03 
 
 		 548 aa  52  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.69 
 
 		 406 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 373 aa  52  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3548  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 		 313 aa  52  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.385244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 270 aa  51.6  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 879 aa  51.6  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 583 aa  51.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 542 aa  51.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>