More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2337 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
564 aa  1157    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  91.5 
 
 
586 aa  1058    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 
511 aa  299  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.46 
 
 
510 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0595  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.51 
 
 
730 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
535 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  41.53 
 
 
535 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.5 
 
 
531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
535 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
535 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3985  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.98 
 
 
730 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
541 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
816 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
463 aa  157  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  38.74 
 
 
529 aa  156  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
644 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1496  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.56 
 
 
741 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
405 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
679 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  35.98 
 
 
496 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
387 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  35.45 
 
 
696 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
421 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
1066 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
373 aa  143  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
1516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
884 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
1383 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
815 aa  140  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
1138 aa  140  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
646 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
474 aa  140  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
643 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
728 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
701 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
1484 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
581 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
958 aa  137  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
646 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1259 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
342 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
639 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
733 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2539  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.787523  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  33.43 
 
 
689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
930 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  33.06 
 
 
648 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
874 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
770 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
418 aa  133  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  25.46 
 
 
698 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  30.8 
 
 
1400 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  29.55 
 
 
1340 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
373 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  34.23 
 
 
698 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
446 aa  131  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
639 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
389 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
708 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  30.22 
 
 
1418 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
620 aa  130  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
614 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
1258 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  26.98 
 
 
453 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  26.98 
 
 
453 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  26.98 
 
 
453 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  26.98 
 
 
459 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
372 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00620911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  26.94 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  25.64 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  31.49 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
716 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
1039 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  33.48 
 
 
1384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  28.61 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  31.65 
 
 
470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
592 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
376 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
584 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
500 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
1406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
641 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  37.05 
 
 
535 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4322  histidine kinase  35.4 
 
 
636 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.461598  normal  0.0714354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
1741 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
630 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
494 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
528 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
763 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  30.43 
 
 
1306 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
386 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
589 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  31.15 
 
 
1366 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
613 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>