130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2313 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  100 
 
 		 496 aa  1026    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  31.86 
 
 		 505 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  30.05 
 
 		 513 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  26.16 
 
 		 349 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 406 aa  62  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  25.06 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  32.56 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  28.68 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  36.36 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  35.23 
 
 		 465 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  40 
 
 		 670 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.1 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  39.19 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  39.81 
 
 		 695 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  43.66 
 
 		 597 aa  54.7  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.26 
 
 		 582 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  31.15 
 
 		 461 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  31.76 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  40.54 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  38.2 
 
 		 657 aa  53.5  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  45.28 
 
 		 666 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  35.21 
 
 		 666 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 652 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.35 
 
 		 429 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  34.48 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  35.29 
 
 		 623 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  26.11 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  25.38 
 
 		 645 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  34.21 
 
 		 398 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  51.06 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  36.84 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  38.24 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  34.21 
 
 		 478 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  40.54 
 
 		 408 aa  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  21.99 
 
 		 669 aa  50.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.36 
 
 		 614 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  35.14 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.28 
 
 		 626 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  29.41 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  26.53 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  44.44 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  34.12 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  37.68 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  42.31 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  27.46 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.69 
 
 		 681 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  35.29 
 
 		 577 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  31.68 
 
 		 378 aa  47.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  36.23 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  29.41 
 
 		 527 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  28.57 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.94 
 
 		 642 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  43.18 
 
 		 697 aa  47.4  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  32.22 
 
 		 355 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  33.82 
 
 		 588 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  40.38 
 
 		 377 aa  47  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  36.49 
 
 		 604 aa  47  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  40.28 
 
 		 397 aa  47  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  36.59 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.57 
 
 		 595 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  26.44 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  26.95 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  52.27 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  37.5 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  33.01 
 
 		 508 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  34.48 
 
 		 606 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  31.25 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.34 
 
 		 607 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.04 
 
 		 608 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  27.59 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  32.47 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  35.06 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  34.29 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  25.36 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  37.5 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  32.95 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  42 
 
 		 676 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.36 
 
 		 594 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  36 
 
 		 140 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  25.34 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  33 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  21.72 
 
 		 659 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  28.12 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  37.14 
 
 		 626 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  30.26 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  35.71 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  31.71 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  31.4 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  30.53 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  46.34 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.68 
 
 		 548 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  31.96 
 
 		 653 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  28.05 
 
 		 532 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  35.48 
 
 		 598 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  46.15 
 
 		 586 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.5 
 
 		 639 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  22.91 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>