225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2287 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 278 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  92.7 
 
 		 274 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  78.44 
 
 		 295 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  79.1 
 
 		 276 aa  415  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  70.26 
 
 		 278 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  68.68 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  65.54 
 
 		 277 aa  363  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  66.04 
 
 		 278 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  66.16 
 
 		 284 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  66.29 
 
 		 285 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  66.29 
 
 		 285 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  65.54 
 
 		 285 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  65.3 
 
 		 289 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  61.42 
 
 		 285 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  65.17 
 
 		 293 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  50.95 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  40.14 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  41.8 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  39.64 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  39.92 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  42.12 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  39.62 
 
 		 265 aa  165  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  32.97 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  40.55 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  39.45 
 
 		 283 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  41 
 
 		 285 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  38.43 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  39.43 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  38.04 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  39.93 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  40.39 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.84 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  37.6 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  38.87 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  36.29 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  37.94 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  37.16 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  34.69 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  37.31 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  35.89 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  38.37 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  38.49 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  36.63 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  34.89 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  35.14 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  36.76 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  38.06 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  40.71 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  35.97 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  36.88 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  35.58 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  37.6 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  36.59 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  36.25 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  35.19 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  36.19 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  37.3 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  37.14 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2432  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.732467  normal  0.678442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  39.37 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  39.37 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  39.37 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  39.37 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  36.08 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>