223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2237 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  29.89 
 
 
255 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  35.91 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  31.58 
 
 
259 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  27.73 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  31.44 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.06 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  29.61 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  28.23 
 
 
281 aa  79  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  29.15 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  28.16 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.7 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.1 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.02 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
285 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  31.38 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  32.5 
 
 
474 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  30.58 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 
424 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  25.31 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  25.45 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  27.73 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  31.39 
 
 
465 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  30.36 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  30.46 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  23.93 
 
 
311 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 
315 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  28.64 
 
 
397 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  31.88 
 
 
259 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  27.85 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  30 
 
 
415 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  29.86 
 
 
473 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  28.32 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  28.99 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  26.24 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  26.98 
 
 
413 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  24.47 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  30.14 
 
 
442 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
297 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  27.9 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  27.9 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.57 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  26.03 
 
 
312 aa  52.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  25.62 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0508  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.82 
 
 
348 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  21.91 
 
 
305 aa  52.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  28.7 
 
 
259 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.98 
 
 
302 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  26.77 
 
 
412 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  26.34 
 
 
257 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  33.57 
 
 
580 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  34.33 
 
 
307 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  27.88 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  30.83 
 
 
380 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  28.23 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  27.59 
 
 
423 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  29.07 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  29.84 
 
 
868 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.59 
 
 
575 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  34.51 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  32.64 
 
 
467 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.33 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  32.08 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  22.97 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  30.4 
 
 
222 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  30.4 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  22.5 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  31.4 
 
 
254 aa  49.7  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1295  hypothetical protein  29.36 
 
 
326 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00733606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
290 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
313 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
313 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  33.33 
 
 
897 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  33.6 
 
 
269 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  33.66 
 
 
290 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
313 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  27.32 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  24.86 
 
 
405 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  31.86 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.62 
 
 
315 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  37.97 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  24.51 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  32.69 
 
 
317 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  27.54 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  30.99 
 
 
451 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  32.48 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0085  hypothetical protein  25.65 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>