More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2206 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  61.16 
 
 		 942 aa  974    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  58.8 
 
 		 932 aa  922    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  58.42 
 
 		 928 aa  931    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  100 
 
 		 928 aa  1797    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.58 
 
 		 1499 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  29.55 
 
 		 1156 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.9 
 
 		 4798 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  35.6 
 
 		 946 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  28.88 
 
 		 3954 aa  127  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.53 
 
 		 1400 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.22 
 
 		 1180 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.53 
 
 		 2911 aa  120  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  29.95 
 
 		 4334 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.67 
 
 		 1279 aa  119  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.88 
 
 		 3598 aa  118  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  28.32 
 
 		 1079 aa  117  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  28.46 
 
 		 860 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  28.4 
 
 		 1217 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  26.8 
 
 		 2133 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  27.3 
 
 		 4723 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.06 
 
 		 855 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  27.9 
 
 		 3026 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.62 
 
 		 2667 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.1 
 
 		 1582 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.08 
 
 		 2678 aa  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.17 
 
 		 795 aa  108  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  28.72 
 
 		 1534 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  29.38 
 
 		 1480 aa  107  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  29.1 
 
 		 1532 aa  107  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.76 
 
 		 2107 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.89 
 
 		 2954 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.11 
 
 		 1363 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.84 
 
 		 2775 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  30.1 
 
 		 518 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.37 
 
 		 824 aa  100  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  32.03 
 
 		 556 aa  99  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1424 aa  99  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  27.3 
 
 		 1421 aa  99  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  28.28 
 
 		 1855 aa  96.3  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  31.99 
 
 		 820 aa  94.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  30.95 
 
 		 3619 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  34.29 
 
 		 1164 aa  92.4  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.55 
 
 		 3619 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.75 
 
 		 2245 aa  91.3  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  33.47 
 
 		 589 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.26 
 
 		 1415 aa  90.5  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.36 
 
 		 2689 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.47 
 
 		 1236 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  35.22 
 
 		 1055 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.82 
 
 		 2105 aa  88.2  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  28.75 
 
 		 682 aa  88.2  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.33 
 
 		 1019 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.58 
 
 		 3209 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  27.45 
 
 		 1884 aa  87  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  29.86 
 
 		 959 aa  87  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.91 
 
 		 2097 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.73 
 
 		 980 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  36.3 
 
 		 3608 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  35.06 
 
 		 833 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  28.81 
 
 		 1403 aa  84.7  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  44.53 
 
 		 2178 aa  84.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  28.93 
 
 		 1286 aa  84  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.27 
 
 		 1895 aa  84  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  31.43 
 
 		 965 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  25.37 
 
 		 2836 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  38.27 
 
 		 329 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  38.27 
 
 		 329 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  27.39 
 
 		 1168 aa  82.4  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  28.44 
 
 		 998 aa  82.4  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  27.53 
 
 		 1544 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  33.98 
 
 		 534 aa  82.4  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  28.49 
 
 		 4800 aa  82  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  62.16 
 
 		 4106 aa  81.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.68 
 
 		 2145 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.1 
 
 		 3427 aa  81.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.31 
 
 		 1795 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  33.75 
 
 		 462 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.92 
 
 		 588 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  28.39 
 
 		 5769 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  58.11 
 
 		 421 aa  80.1  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  28.71 
 
 		 3193 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  34.19 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  29.98 
 
 		 595 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  28.16 
 
 		 2950 aa  79  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  34.58 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1306 aa  78.2  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  30.5 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  42.19 
 
 		 813 aa  77.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  30.85 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.92 
 
 		 2807 aa  77  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  42.6 
 
 		 2885 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  33.73 
 
 		 491 aa  77.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 		 709 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.98 
 
 		 4687 aa  76.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  27.22 
 
 		 1383 aa  76.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  28.54 
 
 		 856 aa  76.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  28.24 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.84 
 
 		 2467 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  38.62 
 
 		 202 aa  75.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>