More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2189 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  86.76 
 
 		 290 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  43.31 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  47.35 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  42.42 
 
 		 284 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  40.28 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  41.97 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  36.09 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  38.85 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  38.16 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  40.44 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  40.07 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  39.93 
 
 		 450 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  37.28 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  34.84 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  37.59 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  35.82 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  37.98 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  30.58 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  33.56 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  34.39 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  31.69 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  29.47 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  30.13 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  36.6 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  33.61 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  37.23 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  29.62 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  37.02 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.65 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  35.62 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  29.81 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  34.08 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.71 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  30.07 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  36.21 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  31.74 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  36.21 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  30.23 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  28.16 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  33.91 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  31.2 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  24.64 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  24.64 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  29.96 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  34.48 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  34.91 
 
 		 287 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  32.05 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  28.82 
 
 		 339 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  29.35 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  29.35 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  27.84 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.48 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  30.16 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  27.27 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  33.04 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  28.29 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  29.35 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  30.77 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  31.95 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  28.47 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  31.52 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.81 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  28.93 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  31.36 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  29.26 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  34.29 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  32.96 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  30.13 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.44 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.89 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  31.33 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  32.78 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.42 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.48 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.5 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  30.17 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  26.07 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.49 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  29.66 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.5 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  25 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  27.06 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  33.11 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  30.08 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  33.33 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  32.03 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  31.3 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  31.09 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.25 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  32.9 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  30.82 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.66 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.92 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>