121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2119 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
142 aa  294  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  93.66 
 
 
142 aa  259  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.04 
 
 
139 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.05 
 
 
168 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.24 
 
 
211 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.36 
 
 
184 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.6 
 
 
219 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.38 
 
 
183 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.54 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.7 
 
 
368 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.81 
 
 
210 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
214 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
214 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.73 
 
 
212 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.73 
 
 
253 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.44 
 
 
270 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.14 
 
 
251 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.58 
 
 
270 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.89 
 
 
260 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  39.44 
 
 
264 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.07 
 
 
209 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.35 
 
 
269 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39 
 
 
247 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.18 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  40.4 
 
 
418 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0685  hypothetical protein  42.22 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  34.23 
 
 
411 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  40 
 
 
330 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  32.28 
 
 
344 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.65 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  33.93 
 
 
361 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  40 
 
 
419 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  31.5 
 
 
347 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  36.7 
 
 
408 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  31.5 
 
 
354 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.02 
 
 
250 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.39 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  35.9 
 
 
493 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.73 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.7 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  35.71 
 
 
588 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.37 
 
 
257 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.11 
 
 
370 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  35.29 
 
 
349 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  36.79 
 
 
519 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  35.34 
 
 
520 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  33.63 
 
 
568 aa  53.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.71 
 
 
475 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  38.04 
 
 
537 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.47 
 
 
407 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  34.19 
 
 
503 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  35.87 
 
 
575 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.96 
 
 
309 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.62 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.42 
 
 
481 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.25 
 
 
376 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.48 
 
 
215 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 
295 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  28.46 
 
 
276 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.73 
 
 
303 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  36.79 
 
 
503 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.7 
 
 
396 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.23 
 
 
236 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.19 
 
 
398 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  36.54 
 
 
496 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  34.91 
 
 
536 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24.79 
 
 
205 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.62 
 
 
413 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0095  hypothetical protein  30.63 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1762  enhanced entry protein  40.68 
 
 
214 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0425  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.68 
 
 
214 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.703074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.71 
 
 
278 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 
171 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.32 
 
 
307 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.33 
 
 
309 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1341  hypothetical protein  45.1 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1337  hypothetical protein  45.1 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.61 
 
 
217 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  38.46 
 
 
245 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  38.46 
 
 
245 aa  44.3  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  30.65 
 
 
235 aa  43.5  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0972  hypothetical protein  45 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  35.82 
 
 
248 aa  42.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0942  hypothetical protein  45 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25 
 
 
332 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.47 
 
 
303 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.69 
 
 
278 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2050  enhanced entry protein  40.98 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.752408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0142  putative enhanced entry protein EnhA  40.98 
 
 
232 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.387138  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.22 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166539 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0759  hypothetical protein  38.89 
 
 
203 aa  42  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0741  hypothetical protein  38.89 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  35.82 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.69 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.1 
 
 
266 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258239  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  27.46 
 
 
253 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32 
 
 
206 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1939  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.81 
 
 
187 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.19325 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>