178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2094 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  43.08 
 
 
802 aa  647    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  68.13 
 
 
824 aa  1182    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  92.8 
 
 
819 aa  1598    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  72.5 
 
 
815 aa  1249    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  100 
 
 
819 aa  1705    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  41.66 
 
 
802 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  37.03 
 
 
845 aa  558  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.38 
 
 
845 aa  533  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  35.31 
 
 
864 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.8 
 
 
842 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 
863 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  33.33 
 
 
813 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 
871 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 
891 aa  429  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  34.43 
 
 
875 aa  425  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  32.85 
 
 
891 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  32.33 
 
 
860 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  32.41 
 
 
861 aa  408  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 
786 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.7 
 
 
813 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  33.08 
 
 
785 aa  399  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
793 aa  389  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.97 
 
 
872 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.23 
 
 
835 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  32.57 
 
 
824 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  34.14 
 
 
829 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  32.23 
 
 
819 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  33.17 
 
 
812 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  31.67 
 
 
823 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  33.9 
 
 
840 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  34.75 
 
 
833 aa  353  7e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.6 
 
 
818 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  33.24 
 
 
839 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  36.39 
 
 
799 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  30.47 
 
 
837 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  45.94 
 
 
897 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  30.16 
 
 
837 aa  344  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.56 
 
 
843 aa  343  5.999999999999999e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.94 
 
 
817 aa  340  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  33.04 
 
 
831 aa  337  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.27 
 
 
843 aa  336  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  33.86 
 
 
838 aa  334  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  30.98 
 
 
846 aa  333  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  30.87 
 
 
847 aa  322  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  31.28 
 
 
880 aa  318  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28 
 
 
940 aa  305  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  39.77 
 
 
663 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  24.26 
 
 
845 aa  208  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  27.23 
 
 
821 aa  185  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  25.09 
 
 
820 aa  170  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.86 
 
 
826 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 
816 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.58 
 
 
826 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 
853 aa  157  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  26.48 
 
 
839 aa  152  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 
763 aa  151  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 
744 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  29.45 
 
 
828 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  29.45 
 
 
828 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  29.45 
 
 
828 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  29.67 
 
 
816 aa  145  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  26.9 
 
 
839 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  26.9 
 
 
839 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  26.9 
 
 
839 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  26.9 
 
 
839 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  26.9 
 
 
839 aa  144  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  26.9 
 
 
839 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  28.2 
 
 
827 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  27.03 
 
 
839 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  28.73 
 
 
812 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25.74 
 
 
882 aa  142  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  26.14 
 
 
856 aa  140  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  24.84 
 
 
882 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  26.62 
 
 
811 aa  140  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.71 
 
 
878 aa  134  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  27.89 
 
 
825 aa  132  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.53 
 
 
815 aa  122  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  26.93 
 
 
962 aa  114  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.3 
 
 
984 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 
734 aa  105  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 
724 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.28 
 
 
720 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.91 
 
 
971 aa  97.8  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 
739 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  22.19 
 
 
906 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 
1144 aa  88.2  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.42 
 
 
1362 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  25.15 
 
 
1270 aa  85.9  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.55 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.94 
 
 
614 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  22.08 
 
 
862 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.66 
 
 
800 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.49 
 
 
757 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  24.36 
 
 
704 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  22.78 
 
 
897 aa  60.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  29.96 
 
 
613 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.35 
 
 
741 aa  60.1  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.44 
 
 
602 aa  60.1  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  23.47 
 
 
972 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.6 
 
 
858 aa  59.3  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>