More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2034 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
326 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2256  inner-membrane translocator  98.16 
 
 
326 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0269001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3127  monosaccharide-transporting ATPase  71.52 
 
 
324 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960892  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2400  ribose ABC transporter, permease protein  61.51 
 
 
334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  50 
 
 
310 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  50.33 
 
 
310 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  51.55 
 
 
835 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  52.4 
 
 
319 aa  235  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  44.52 
 
 
333 aa  235  8e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  49.17 
 
 
336 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  44.31 
 
 
324 aa  228  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
330 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  45.15 
 
 
330 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  45.15 
 
 
330 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  45.48 
 
 
324 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  50.89 
 
 
327 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  45.02 
 
 
311 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  47.54 
 
 
311 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  47.54 
 
 
311 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  47.54 
 
 
311 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  45.7 
 
 
331 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  47.54 
 
 
311 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  45.06 
 
 
350 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  47.54 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  47.65 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  47.21 
 
 
311 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  47.21 
 
 
311 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  47.21 
 
 
311 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  47.21 
 
 
311 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  45.59 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  47.21 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  49.84 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  44.37 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  49.33 
 
 
348 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  47.04 
 
 
327 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  46.73 
 
 
327 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  45.59 
 
 
321 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  45.59 
 
 
321 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  45.59 
 
 
321 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  45.59 
 
 
321 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  45.59 
 
 
321 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  45.59 
 
 
321 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  45.59 
 
 
321 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  45.59 
 
 
321 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  45.26 
 
 
322 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  46.77 
 
 
322 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  42.72 
 
 
342 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  44.26 
 
 
315 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  45.78 
 
 
321 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 
334 aa  215  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 
334 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  45.85 
 
 
322 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  43.59 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  46.33 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  46.48 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  46.45 
 
 
311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  47.89 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  46.88 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  46.03 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  45.55 
 
 
325 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  43.87 
 
 
322 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
322 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  43.84 
 
 
306 aa  209  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  41.78 
 
 
328 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  44 
 
 
294 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  44 
 
 
294 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  44 
 
 
298 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  44 
 
 
279 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  40.56 
 
 
326 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  41.12 
 
 
329 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  44.05 
 
 
310 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  39.88 
 
 
317 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  41.78 
 
 
345 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  41.78 
 
 
345 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  41.78 
 
 
345 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  44 
 
 
317 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 
312 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.78 
 
 
345 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  43.31 
 
 
338 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  44.86 
 
 
324 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  40.61 
 
 
333 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  41.78 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  41.45 
 
 
345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  43.38 
 
 
337 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.82 
 
 
334 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  41.25 
 
 
322 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  43.29 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  41.42 
 
 
319 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.52 
 
 
342 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 
342 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  45.45 
 
 
336 aa  198  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  41.08 
 
 
339 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  44.92 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  39.06 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  40.92 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>