226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2030 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
316 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  96.52 
 
 
316 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  76.11 
 
 
316 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  46.2 
 
 
317 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  42.09 
 
 
314 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  42.09 
 
 
314 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  42.09 
 
 
314 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  42.41 
 
 
314 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  42.12 
 
 
334 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  39.23 
 
 
317 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  39.68 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  37.22 
 
 
331 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  33.88 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  33.88 
 
 
315 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  33.55 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
315 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  29.62 
 
 
327 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  30.19 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
310 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  27.56 
 
 
308 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  30.91 
 
 
310 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 
310 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  30.72 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 
310 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
307 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  30.6 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  30.6 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  30.6 
 
 
362 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.97 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  28.04 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  30.41 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  32.9 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  24.28 
 
 
315 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  29.65 
 
 
319 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.87 
 
 
694 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
339 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
345 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  28.3 
 
 
315 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  30.13 
 
 
337 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
339 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
339 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
317 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  28.3 
 
 
315 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
333 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  27.99 
 
 
315 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  31.95 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  31.95 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  31.95 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  31.95 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  31.95 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  30.55 
 
 
694 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
312 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  31.95 
 
 
339 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  31.95 
 
 
339 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  30.87 
 
 
319 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  30.87 
 
 
319 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  30.87 
 
 
319 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  30.87 
 
 
319 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  30.87 
 
 
319 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
320 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  30.57 
 
 
321 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
339 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  26.89 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  29.84 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  29.35 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  29.84 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  29.84 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
320 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
339 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  30.35 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  27.65 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  27.65 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  31.73 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  29.51 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  30.77 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  29.02 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  28.85 
 
 
323 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  26.9 
 
 
326 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>