More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2016 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  100 
 
 
463 aa  956    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  67.97 
 
 
472 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  70.41 
 
 
463 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  70.22 
 
 
475 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  81.96 
 
 
462 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  69.89 
 
 
465 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  71.27 
 
 
464 aa  679    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  86.8 
 
 
482 aa  853    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  67.97 
 
 
472 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  82.39 
 
 
466 aa  803    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  70.41 
 
 
478 aa  672    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  85.96 
 
 
463 aa  811    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  69.91 
 
 
472 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  70.84 
 
 
462 aa  676    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  71.92 
 
 
463 aa  682    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  67.17 
 
 
465 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  71.21 
 
 
463 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  80.74 
 
 
463 aa  785    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  71.06 
 
 
464 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  70.84 
 
 
464 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  69.5 
 
 
474 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  96.11 
 
 
463 aa  916    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  70.43 
 
 
465 aa  675    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  67.25 
 
 
469 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  67.76 
 
 
472 aa  633  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  67.82 
 
 
464 aa  631  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  67.39 
 
 
469 aa  630  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  65.51 
 
 
463 aa  631  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  66.96 
 
 
469 aa  627  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  66.67 
 
 
469 aa  626  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  67.46 
 
 
471 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  69.13 
 
 
472 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  63.46 
 
 
464 aa  610  1e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  64.72 
 
 
492 aa  609  1e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  68.85 
 
 
472 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  64.13 
 
 
468 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  63.7 
 
 
465 aa  600  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  63.93 
 
 
462 aa  599  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  62.93 
 
 
544 aa  593  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  63.26 
 
 
510 aa  586  1e-166  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  60.7 
 
 
464 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  61.74 
 
 
464 aa  579  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  61.79 
 
 
461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  60.87 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  60.48 
 
 
464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  61.34 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  61.34 
 
 
463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  60.92 
 
 
461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  60.92 
 
 
461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  60.92 
 
 
465 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  60.26 
 
 
461 aa  570  1e-161  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  60.95 
 
 
464 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  60.13 
 
 
474 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  61.17 
 
 
464 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  60.26 
 
 
463 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  61.17 
 
 
464 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  60.48 
 
 
461 aa  566  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  61.66 
 
 
631 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  60.78 
 
 
464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  59.83 
 
 
461 aa  559  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  61.77 
 
 
464 aa  559  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  60.78 
 
 
462 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  60.78 
 
 
462 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  59.91 
 
 
463 aa  555  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  60.78 
 
 
462 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  60.39 
 
 
466 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  60.35 
 
 
462 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  58.11 
 
 
459 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  60.35 
 
 
462 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  60.57 
 
 
462 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  61.49 
 
 
466 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  60.57 
 
 
462 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  59.65 
 
 
463 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  58.11 
 
 
459 aa  551  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  60.13 
 
 
462 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  58.57 
 
 
465 aa  549  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  59.26 
 
 
463 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  60.57 
 
 
462 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  60.13 
 
 
462 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  59.04 
 
 
463 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  59.1 
 
 
465 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  61.71 
 
 
466 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  58.52 
 
 
469 aa  549  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  58.35 
 
 
465 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  59.91 
 
 
462 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  59.35 
 
 
463 aa  547  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  59.04 
 
 
463 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  61 
 
 
487 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  59.35 
 
 
463 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  59.56 
 
 
458 aa  545  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>