206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1842 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  93.94 
 
 
203 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  67.17 
 
 
201 aa  291  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  62.12 
 
 
200 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  54.04 
 
 
203 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  51.01 
 
 
203 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  50.51 
 
 
203 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  48.95 
 
 
216 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  50.25 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  47.37 
 
 
203 aa  185  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  46.73 
 
 
201 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  45.64 
 
 
207 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  46 
 
 
201 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  49.49 
 
 
194 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.96 
 
 
209 aa  177  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.77 
 
 
201 aa  177  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  45.77 
 
 
201 aa  177  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  45.23 
 
 
201 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  45.23 
 
 
201 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  45.79 
 
 
205 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  44.55 
 
 
207 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  46.07 
 
 
218 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  43.43 
 
 
212 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  46.11 
 
 
208 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  47.21 
 
 
208 aa  175  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  46.11 
 
 
208 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  47.37 
 
 
201 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  45.27 
 
 
208 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  45.1 
 
 
209 aa  174  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  47.98 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  47.22 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  45.86 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  47.22 
 
 
221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  44.16 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  45.6 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  49.71 
 
 
209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  47.47 
 
 
194 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.35 
 
 
209 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  47.8 
 
 
201 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  46.88 
 
 
206 aa  168  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  46.04 
 
 
209 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  46.88 
 
 
230 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  45.36 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  44.33 
 
 
205 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  46.34 
 
 
201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  45.08 
 
 
207 aa  164  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  47.8 
 
 
201 aa  164  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  43.54 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  45.36 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  44.79 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  45.18 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  45.18 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  45.08 
 
 
205 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  44.27 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  47.4 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  44.67 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  43.75 
 
 
202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  43.75 
 
 
207 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.1 
 
 
209 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  44.62 
 
 
209 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  44.16 
 
 
208 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  44.39 
 
 
220 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  41.95 
 
 
210 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  44.33 
 
 
202 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  42.93 
 
 
208 aa  158  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  43.15 
 
 
208 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  47.4 
 
 
221 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  43.2 
 
 
212 aa  154  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  44.79 
 
 
209 aa  154  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  43.75 
 
 
206 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  43.5 
 
 
230 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  43.5 
 
 
230 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  42.38 
 
 
241 aa  149  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  41.54 
 
 
209 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  41.5 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  40.67 
 
 
218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  44.89 
 
 
210 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  42.19 
 
 
206 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  40.49 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  40.31 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  37.25 
 
 
209 aa  134  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  37.56 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33014  predicted protein  40 
 
 
436 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  39.38 
 
 
203 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  52.17 
 
 
140 aa  121  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.91 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  38.34 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.04 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.09 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.6 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  36.17 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  35.16 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  35.16 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  36.7 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  35.16 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  35.16 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.26 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  35.16 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  35.16 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  35.16 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>