64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1818 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 
84 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  88.1 
 
 
84 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  60 
 
 
82 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  55.95 
 
 
82 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  61.45 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  60.71 
 
 
83 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  54.76 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  71.21 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  68.18 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  52.38 
 
 
82 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  56.72 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  58.21 
 
 
83 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 
96 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  56.72 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  46.84 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  58.33 
 
 
83 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  49.41 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  48.24 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  46.84 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  46.84 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  46.05 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  42.35 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  48.65 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  48.65 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  48.65 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  45.57 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  45.95 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 
80 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  39.53 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  45 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  39.19 
 
 
84 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  35.29 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  38.64 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  44.59 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  45.95 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  45.95 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  40.91 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  43.24 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  45.95 
 
 
115 aa  42  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  35.06 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  45.95 
 
 
83 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  45.95 
 
 
117 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  45.95 
 
 
83 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  45.95 
 
 
77 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  45.95 
 
 
83 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  43.84 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  38.24 
 
 
83 aa  40  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>