More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1728 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
701 aa  1406    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.64 
 
 
697 aa  730    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.73 
 
 
729 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.67 
 
 
706 aa  945    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.29 
 
 
729 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  94.86 
 
 
701 aa  1346    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.37 
 
 
731 aa  715    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.81 
 
 
706 aa  940    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.82 
 
 
690 aa  733    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  54.84 
 
 
699 aa  735    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.92 
 
 
695 aa  664    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.87 
 
 
729 aa  720    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.53 
 
 
706 aa  941    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.47 
 
 
700 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.65 
 
 
691 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  77.32 
 
 
701 aa  1124    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.31 
 
 
703 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.77 
 
 
700 aa  699    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  55.05 
 
 
728 aa  697    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.92 
 
 
695 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 
700 aa  663    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  77.03 
 
 
790 aa  1115    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.5 
 
 
686 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  55.27 
 
 
699 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.25 
 
 
704 aa  715    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  54.7 
 
 
727 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  54.42 
 
 
699 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.14 
 
 
697 aa  656    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.07 
 
 
696 aa  670    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.17 
 
 
702 aa  870    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.07 
 
 
695 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.26 
 
 
694 aa  794    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.57 
 
 
694 aa  693    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.57 
 
 
750 aa  716    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.78 
 
 
696 aa  664    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.74 
 
 
702 aa  840    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.4 
 
 
704 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  49.36 
 
 
685 aa  613  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.21 
 
 
723 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.8 
 
 
709 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.44 
 
 
679 aa  568  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.74 
 
 
701 aa  557  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.74 
 
 
673 aa  548  1e-154  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  41.11 
 
 
678 aa  547  1e-154  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.59 
 
 
693 aa  542  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.9 
 
 
686 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.9 
 
 
686 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.71 
 
 
691 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.02 
 
 
705 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.21 
 
 
691 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 
704 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.41 
 
 
697 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 
704 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.37 
 
 
705 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.33 
 
 
691 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 
772 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.49 
 
 
765 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.7 
 
 
717 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.57 
 
 
772 aa  492  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.75 
 
 
690 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.37 
 
 
690 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.36 
 
 
683 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 
712 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.87 
 
 
767 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.59 
 
 
691 aa  492  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.78 
 
 
832 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.85 
 
 
829 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 
691 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.68 
 
 
737 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 
693 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 
696 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.71 
 
 
815 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.7 
 
 
747 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 
693 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 
693 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 
703 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.98 
 
 
691 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.46 
 
 
693 aa  483  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.63 
 
 
692 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.97 
 
 
693 aa  485  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.29 
 
 
778 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 
700 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.8 
 
 
691 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.41 
 
 
740 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.92 
 
 
692 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.56 
 
 
693 aa  482  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.59 
 
 
690 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.47 
 
 
819 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.21 
 
 
691 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.51 
 
 
827 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 
692 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.56 
 
 
684 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.48 
 
 
902 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.17 
 
 
696 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.88 
 
 
728 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.03 
 
 
859 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.33 
 
 
902 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.17 
 
 
696 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.63 
 
 
690 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.33 
 
 
902 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>