More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1708 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  96.75 
 
 
400 aa  744  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
400 aa  793  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  59.2 
 
 
401 aa  461  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  58.46 
 
 
401 aa  461  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  56.97 
 
 
402 aa  458  1e-128  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  57.46 
 
 
400 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  55.58 
 
 
403 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  55.22 
 
 
400 aa  439  1e-122  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  55.36 
 
 
402 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  55.69 
 
 
401 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  53.62 
 
 
402 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  52.02 
 
 
403 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  53.62 
 
 
402 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  55.69 
 
 
401 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  55.69 
 
 
401 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  54.22 
 
 
400 aa  418  1e-115  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  50.23 
 
 
456 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  55.47 
 
 
402 aa  407  1e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  56.36 
 
 
403 aa  401  1e-110  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  44.47 
 
 
409 aa  310  3e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  44.47 
 
 
409 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  44.47 
 
 
409 aa  308  1e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  40.75 
 
 
406 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  43.6 
 
 
409 aa  306  5e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  44.33 
 
 
409 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  39.36 
 
 
406 aa  302  6e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  44.55 
 
 
409 aa  298  9e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  44.42 
 
 
402 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  40.49 
 
 
412 aa  297  3e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  43.95 
 
 
406 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  43.35 
 
 
409 aa  295  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57118e-10 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  41.06 
 
 
405 aa  295  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  43.1 
 
 
409 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  41.38 
 
 
405 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  41.63 
 
 
408 aa  290  5e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  38.25 
 
 
406 aa  282  9e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  42.2 
 
 
409 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  37.84 
 
 
406 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.72644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  42.86 
 
 
411 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  38.96 
 
 
658 aa  273  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  41.5 
 
 
661 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  40.62 
 
 
418 aa  270  3e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  35.45 
 
 
715 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  41.44 
 
 
404 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  42.86 
 
 
409 aa  267  3e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  39.56 
 
 
411 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  39.14 
 
 
656 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  42.72 
 
 
405 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  40.71 
 
 
412 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  43.49 
 
 
406 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  40.94 
 
 
707 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  41.01 
 
 
410 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  38.5 
 
 
657 aa  258  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  39.66 
 
 
657 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  39.51 
 
 
391 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  39.32 
 
 
443 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  38.69 
 
 
647 aa  254  1e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  40.25 
 
 
403 aa  254  2e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  40.1 
 
 
671 aa  254  2e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  38.52 
 
 
644 aa  254  2e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  41.42 
 
 
408 aa  254  2e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  38.38 
 
 
653 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  39.8 
 
 
407 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  37.71 
 
 
670 aa  249  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  37.28 
 
 
405 aa  249  7e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  39.01 
 
 
405 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  38.83 
 
 
405 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  39.17 
 
 
409 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.33 
 
 
678 aa  244  2e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.05037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  38.33 
 
 
678 aa  244  2e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  38.33 
 
 
678 aa  244  2e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.85404e-05  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  38.38 
 
 
657 aa  244  2e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  40.39 
 
 
410 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  38.78 
 
 
409 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  37.81 
 
 
657 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  38.27 
 
 
409 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  34.79 
 
 
454 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  39.51 
 
 
405 aa  240  3e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  37.87 
 
 
405 aa  240  3e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  37.38 
 
 
405 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  36.32 
 
 
394 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  37.86 
 
 
409 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  37.28 
 
 
649 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  39.22 
 
 
405 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.31 
 
 
663 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  39.22 
 
 
405 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.19 
 
 
663 aa  235  1e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  39.05 
 
 
392 aa  235  1e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  35.75 
 
 
651 aa  232  7e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  36.43 
 
 
400 aa  232  7e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  7.60178e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 
654 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  37.71 
 
 
423 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  35.73 
 
 
652 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  37.97 
 
 
653 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  36.61 
 
 
647 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  37.53 
 
 
650 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  36.98 
 
 
410 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  39.34 
 
 
417 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  41.69 
 
 
650 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  36 
 
 
643 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>