More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1626 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2096  glycine hydroxymethyltransferase  83.29 
 
 		 425 aa  736    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.835184  normal  0.0355089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1626  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 425 aa  869    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696145  normal  0.61537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  55.74 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  55.35 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  55.74 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  55.74 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  55.76 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  53.49 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  52.96 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  52.78 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 431 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  54.78 
 
 		 432 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  52.58 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  53.49 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  53.61 
 
 		 414 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  52.73 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  52.11 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  52.73 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  53.11 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  52.34 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  54.05 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  52.61 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  53.75 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  53.4 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  54 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  52.3 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  53.64 
 
 		 415 aa  441  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2907  serine hydroxymethyltransferase  52.04 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.0486853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  52.31 
 
 		 413 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  52.94 
 
 		 433 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  52.03 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  52.66 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  52.91 
 
 		 427 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  52.94 
 
 		 433 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3100  serine hydroxymethyltransferase  52.16 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4246  glycine hydroxymethyltransferase  52.28 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  52.66 
 
 		 415 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  52.03 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  51.91 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  52.28 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  52.54 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  50.59 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  50.59 
 
 		 431 aa  431  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  51.21 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  52.57 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2283  glycine hydroxymethyltransferase  52.76 
 
 		 425 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0279  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  52.2 
 
 		 425 aa  431  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  52.66 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  52.66 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  53.25 
 
 		 420 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  52.17 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  51.76 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  52.83 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  51.69 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  52.44 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  51.08 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  52.28 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  51.44 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  52 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  52.66 
 
 		 415 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  51.34 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  50.24 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  49.52 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  51.93 
 
 		 415 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  50.24 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  52.44 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  52.42 
 
 		 416 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  49.65 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  51.53 
 
 		 424 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  49.52 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  52.42 
 
 		 415 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  52.06 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>