More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1554 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  83.84 
 
 		 759 aa  886    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 677 aa  1338    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  68.67 
 
 		 1066 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.88 
 
 		 428 aa  203  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.12 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.09 
 
 		 463 aa  157  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  41.63 
 
 		 648 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  40.71 
 
 		 745 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  46.63 
 
 		 1971 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  50 
 
 		 1145 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  38.84 
 
 		 768 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  46.36 
 
 		 1202 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  38.26 
 
 		 221 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  37.78 
 
 		 1610 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 		 1610 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  36.76 
 
 		 1424 aa  106  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  36.54 
 
 		 2097 aa  105  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  41.87 
 
 		 2836 aa  103  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  48.61 
 
 		 833 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  52.05 
 
 		 1884 aa  101  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.16 
 
 		 621 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  39.16 
 
 		 621 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  36.26 
 
 		 2133 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  34.91 
 
 		 1079 aa  100  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  36.5 
 
 		 2198 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  48.25 
 
 		 2911 aa  97.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  42.13 
 
 		 4800 aa  95.1  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  57.58 
 
 		 1390 aa  94.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  41.24 
 
 		 1544 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  27.98 
 
 		 502 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.19 
 
 		 2701 aa  92.8  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  36.68 
 
 		 1133 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  35.42 
 
 		 2467 aa  91.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  27.36 
 
 		 341 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  34.57 
 
 		 535 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  42.26 
 
 		 4687 aa  87.8  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.51 
 
 		 588 aa  87.4  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  37.9 
 
 		 260 aa  87  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  46.51 
 
 		 2775 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  33.61 
 
 		 535 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.71 
 
 		 1180 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 		 709 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.18 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.21 
 
 		 1712 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40.91 
 
 		 813 aa  84  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4084  hypothetical protein  36.6 
 
 		 295 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.049689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.98 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2509  hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 		 865 aa  84  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  46.73 
 
 		 1121 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  43.35 
 
 		 202 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  26.68 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  43.35 
 
 		 202 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  46.73 
 
 		 1111 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 		 1213 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  40.88 
 
 		 1112 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  43.45 
 
 		 1628 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  39.77 
 
 		 1017 aa  80.5  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.24 
 
 		 1236 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  39.77 
 
 		 1022 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.85 
 
 		 2678 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  46.88 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  46.85 
 
 		 1403 aa  77.8  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.01 
 
 		 1029 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  38.01 
 
 		 1029 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.01 
 
 		 820 aa  77.4  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  42.57 
 
 		 2667 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.7 
 
 		 421 aa  76.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.97 
 
 		 1019 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  30.45 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.89 
 
 		 1037 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  38.01 
 
 		 3209 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  34.69 
 
 		 1895 aa  75.1  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  45.13 
 
 		 2704 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  44.27 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  41.67 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  45.9 
 
 		 1112 aa  74.3  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  35.38 
 
 		 1164 aa  74.3  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  36.32 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  41.22 
 
 		 2885 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  36.9 
 
 		 490 aa  73.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  37.01 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  38.42 
 
 		 850 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  30.74 
 
 		 475 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  31.69 
 
 		 727 aa  72  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.03 
 
 		 2346 aa  71.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.38 
 
 		 1839 aa  71.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.44 
 
 		 2954 aa  70.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  27.19 
 
 		 563 aa  70.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  34.91 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  36.54 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  50 
 
 		 998 aa  70.5  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  34.69 
 
 		 1055 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  35.02 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  46.34 
 
 		 553 aa  70.1  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.87 
 
 		 946 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  29.09 
 
 		 901 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.1 
 
 		 3427 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  35.45 
 
 		 1883 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>