291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1495 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
115 aa  226  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  96.52 
 
 
115 aa  200  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  74.78 
 
 
123 aa  157  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  70.54 
 
 
110 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  59.09 
 
 
113 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  59.09 
 
 
113 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  58.18 
 
 
113 aa  130  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  55.96 
 
 
133 aa  120  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  53.51 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  54.87 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  50.88 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  51.3 
 
 
111 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  53.85 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  53.85 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  46.96 
 
 
143 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  55.21 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  57.78 
 
 
114 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  53.85 
 
 
115 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  52.25 
 
 
146 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  58.89 
 
 
111 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  51.35 
 
 
142 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  53.15 
 
 
146 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  55.95 
 
 
105 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  55 
 
 
104 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  56.63 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  56.98 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  53.57 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  52.68 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  52.68 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  48.31 
 
 
93 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  56.63 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  54.02 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  47.66 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  43.69 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  46.67 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  48.24 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  42.37 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.97 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1182  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
119 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.714716  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  39.25 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  37.74 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  41.51 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  38.53 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  43.04 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  42.99 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  42.99 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  34.91 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  38.83 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  43.59 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  40.59 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  34.91 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  39.56 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  37.08 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  36.19 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  39.77 
 
 
114 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  35.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  39.33 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  41.86 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  35.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  31.19 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>