More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1372 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
510 aa  1053  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  90.59 
 
 
511 aa  949  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  54.41 
 
 
586 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.46 
 
 
564 aa  287  3e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 
535 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  43.98 
 
 
535 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
535 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
535 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
463 aa  174  3e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  38.02 
 
 
529 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  37.66 
 
 
496 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.47 
 
 
531 aa  164  4e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
679 aa  164  5e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
744 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
644 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 
844 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
701 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
500 aa  157  5e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
911 aa  154  3e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
816 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
405 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
1111 aa  154  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
541 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
770 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
843 aa  149  1e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
387 aa  148  2e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
581 aa  148  2e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  26.23 
 
 
1159 aa  147  4e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  26.23 
 
 
1159 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
377 aa  147  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
592 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.1549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
733 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  28.32 
 
 
816 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
969 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
815 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
1066 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
373 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  24.19 
 
 
1147 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
474 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  28.67 
 
 
537 aa  143  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  25 
 
 
1177 aa  143  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
587 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
1484 aa  142  1e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
498 aa  142  1e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
837 aa  142  1e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
1138 aa  142  1e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
342 aa  142  2e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  27.9 
 
 
771 aa  141  2e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.6 
 
 
486 aa  141  2e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 
1174 aa  142  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
795 aa  141  2e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
352 aa  142  2e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
718 aa  142  2e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
769 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 
1158 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
421 aa  140  4e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
1178 aa  140  4e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
446 aa  140  4e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.49051e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
1516 aa  140  4e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
584 aa  140  4e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
695 aa  140  5e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  25.25 
 
 
1055 aa  140  5e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
779 aa  140  5e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  33.21 
 
 
698 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
608 aa  140  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
1159 aa  140  8e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
861 aa  139  8e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  34.96 
 
 
696 aa  140  8e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  23.9 
 
 
1148 aa  139  9e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  27.84 
 
 
771 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
473 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
587 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
838 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
1352 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.39 
 
 
1159 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
359 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
1259 aa  137  3e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  27.46 
 
 
816 aa  137  3e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 
1159 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.17 
 
 
1274 aa  137  6e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  26.48 
 
 
1006 aa  137  6e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  25.26 
 
 
1141 aa  137  7e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
775 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  31.71 
 
 
400 aa  135  1e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
1341 aa  136  1e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  24.71 
 
 
846 aa  136  1e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  26.31 
 
 
835 aa  136  1e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
830 aa  135  1e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
590 aa  135  1e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 
837 aa  135  2e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
528 aa  135  2e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
797 aa  135  2e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
389 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
589 aa  135  2e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
973 aa  135  2e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
389 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 
1172 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 
1116 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  25.62 
 
 
838 aa  135  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
641 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>