More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1368 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.93 
 
 		 283 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.58 
 
 		 277 aa  371  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.27 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.82 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.3 
 
 		 285 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.69 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 		 281 aa  292  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.44 
 
 		 280 aa  278  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.29 
 
 		 282 aa  275  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 		 296 aa  261  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.29 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 		 284 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  42.24 
 
 		 278 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 		 286 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 		 283 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  42.6 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  41.84 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  39.54 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  44.12 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  42.03 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  42.09 
 
 		 284 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 		 282 aa  208  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 273 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  42.14 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.76 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 		 282 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 		 281 aa  201  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.07 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  40.37 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  39.19 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 		 284 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  39.35 
 
 		 277 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 		 281 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 283 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 277 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>